Protein–RNA interactions for Protein: P55097

Ctsk, Cathepsin K, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtskP55097 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CtskP55097 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CtskP55097 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CtskP55097 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CtskP55097 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CtskP55097 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CtskP55097 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CtskP55097 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CtskP55097 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CtskP55097 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CtskP55097 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CtskP55097 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CtskP55097 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CtskP55097 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CtskP55097 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CtskP55097 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CtskP55097 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CtskP55097 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CtskP55097 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CtskP55097 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CtskP55097 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CtskP55097 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CtskP55097 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CtskP55097 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CtskP55097 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CtskP55097 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CtskP55097 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CtskP55097 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CtskP55097 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CtskP55097 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CtskP55097 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CtskP55097 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CtskP55097 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CtskP55097 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CtskP55097 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CtskP55097 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CtskP55097 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CtskP55097 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CtskP55097 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CtskP55097 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CtskP55097 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CtskP55097 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CtskP55097 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CtskP55097 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CtskP55097 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CtskP55097 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CtskP55097 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CtskP55097 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CtskP55097 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CtskP55097 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CtskP55097 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CtskP55097 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CtskP55097 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CtskP55097 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CtskP55097 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CtskP55097 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CtskP55097 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CtskP55097 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CtskP55097 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CtskP55097 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CtskP55097 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CtskP55097 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CtskP55097 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CtskP55097 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CtskP55097 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CtskP55097 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CtskP55097 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CtskP55097 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CtskP55097 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CtskP55097 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CtskP55097 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CtskP55097 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CtskP55097 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CtskP55097 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CtskP55097 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CtskP55097 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CtskP55097 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CtskP55097 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CtskP55097 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CtskP55097 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CtskP55097 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CtskP55097 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CtskP55097 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CtskP55097 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CtskP55097 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CtskP55097 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CtskP55097 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CtskP55097 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CtskP55097 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CtskP55097 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CtskP55097 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CtskP55097 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CtskP55097 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CtskP55097 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CtskP55097 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CtskP55097 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CtskP55097 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CtskP55097 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CtskP55097 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CtskP55097 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms