Protein–RNA interactions for Protein: P55088

Aqp4, Aquaporin-4, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aqp4P55088 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Aqp4P55088 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Aqp4P55088 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Aqp4P55088 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Aqp4P55088 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Aqp4P55088 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Aqp4P55088 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Aqp4P55088 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Aqp4P55088 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Aqp4P55088 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Aqp4P55088 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Aqp4P55088 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Aqp4P55088 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Aqp4P55088 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Aqp4P55088 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Aqp4P55088 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Aqp4P55088 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Aqp4P55088 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Aqp4P55088 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Aqp4P55088 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Aqp4P55088 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Aqp4P55088 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Aqp4P55088 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Aqp4P55088 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Aqp4P55088 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Aqp4P55088 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Aqp4P55088 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Aqp4P55088 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Aqp4P55088 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Aqp4P55088 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Aqp4P55088 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Aqp4P55088 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Aqp4P55088 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Aqp4P55088 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Aqp4P55088 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Aqp4P55088 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Aqp4P55088 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Aqp4P55088 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Aqp4P55088 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Aqp4P55088 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Aqp4P55088 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Aqp4P55088 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Aqp4P55088 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Aqp4P55088 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Aqp4P55088 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Aqp4P55088 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Aqp4P55088 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Aqp4P55088 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Aqp4P55088 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Aqp4P55088 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Aqp4P55088 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Aqp4P55088 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Aqp4P55088 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Aqp4P55088 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Aqp4P55088 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Aqp4P55088 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Aqp4P55088 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Aqp4P55088 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Aqp4P55088 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Aqp4P55088 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Aqp4P55088 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Aqp4P55088 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Aqp4P55088 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Aqp4P55088 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Aqp4P55088 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Aqp4P55088 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Aqp4P55088 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Aqp4P55088 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Aqp4P55088 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Aqp4P55088 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Aqp4P55088 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Aqp4P55088 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Aqp4P55088 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Aqp4P55088 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Aqp4P55088 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Aqp4P55088 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Aqp4P55088 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Aqp4P55088 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Aqp4P55088 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Aqp4P55088 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Aqp4P55088 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Aqp4P55088 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Aqp4P55088 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Aqp4P55088 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Aqp4P55088 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Aqp4P55088 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Aqp4P55088 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Aqp4P55088 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Aqp4P55088 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Aqp4P55088 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Aqp4P55088 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Aqp4P55088 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Aqp4P55088 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Aqp4P55088 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Aqp4P55088 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Aqp4P55088 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Aqp4P55088 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Aqp4P55088 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Aqp4P55088 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Aqp4P55088 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms