Protein–RNA interactions for Protein: P55014

Slc12a1, Solute carrier family 12 member 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,095 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc12a1P55014 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Slc12a1P55014 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Slc12a1P55014 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Slc12a1P55014 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Slc12a1P55014 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Slc12a1P55014 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Slc12a1P55014 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Slc12a1P55014 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Slc12a1P55014 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Slc12a1P55014 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Slc12a1P55014 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Slc12a1P55014 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Slc12a1P55014 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Slc12a1P55014 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Slc12a1P55014 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Slc12a1P55014 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Slc12a1P55014 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Slc12a1P55014 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Slc12a1P55014 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Slc12a1P55014 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Slc12a1P55014 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Slc12a1P55014 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Slc12a1P55014 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Slc12a1P55014 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Slc12a1P55014 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Slc12a1P55014 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Slc12a1P55014 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Slc12a1P55014 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Slc12a1P55014 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Slc12a1P55014 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Slc12a1P55014 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Slc12a1P55014 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Slc12a1P55014 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Slc12a1P55014 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Slc12a1P55014 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Slc12a1P55014 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Slc12a1P55014 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Slc12a1P55014 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Slc12a1P55014 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Slc12a1P55014 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Slc12a1P55014 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Slc12a1P55014 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Slc12a1P55014 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Slc12a1P55014 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Slc12a1P55014 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Slc12a1P55014 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Slc12a1P55014 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Slc12a1P55014 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Slc12a1P55014 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Slc12a1P55014 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Slc12a1P55014 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Slc12a1P55014 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Slc12a1P55014 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Slc12a1P55014 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Slc12a1P55014 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Slc12a1P55014 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Slc12a1P55014 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Slc12a1P55014 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Slc12a1P55014 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Slc12a1P55014 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Slc12a1P55014 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Slc12a1P55014 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Slc12a1P55014 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Slc12a1P55014 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Slc12a1P55014 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Slc12a1P55014 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Slc12a1P55014 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Slc12a1P55014 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Slc12a1P55014 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Slc12a1P55014 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Slc12a1P55014 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Slc12a1P55014 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Slc12a1P55014 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Slc12a1P55014 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Slc12a1P55014 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Slc12a1P55014 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Slc12a1P55014 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Slc12a1P55014 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Slc12a1P55014 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Slc12a1P55014 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
Slc12a1P55014 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Slc12a1P55014 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Slc12a1P55014 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Slc12a1P55014 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Slc12a1P55014 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Slc12a1P55014 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Slc12a1P55014 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Slc12a1P55014 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Slc12a1P55014 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Slc12a1P55014 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Slc12a1P55014 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Slc12a1P55014 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Slc12a1P55014 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Slc12a1P55014 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Slc12a1P55014 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Slc12a1P55014 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Slc12a1P55014 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Slc12a1P55014 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Slc12a1P55014 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Slc12a1P55014 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms