Protein–RNA interactions for Protein: P54728

Rad23b, UV excision repair protein RAD23 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad23bP54728 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Rad23bP54728 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Rad23bP54728 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Rad23bP54728 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Rad23bP54728 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
Rad23bP54728 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Rad23bP54728 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Rad23bP54728 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Rad23bP54728 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
Rad23bP54728 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Rad23bP54728 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Rad23bP54728 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Rad23bP54728 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Rad23bP54728 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Rad23bP54728 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Rad23bP54728 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Rad23bP54728 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Rad23bP54728 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Rad23bP54728 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Rad23bP54728 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
Rad23bP54728 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Rad23bP54728 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Rad23bP54728 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Rad23bP54728 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Rad23bP54728 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Rad23bP54728 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Rad23bP54728 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Rad23bP54728 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
Rad23bP54728 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Rad23bP54728 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC29■■■□□ 2.23
Rad23bP54728 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Rad23bP54728 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Rad23bP54728 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Rad23bP54728 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Rad23bP54728 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Rad23bP54728 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Rad23bP54728 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Rad23bP54728 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
Rad23bP54728 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Rad23bP54728 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Rad23bP54728 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Rad23bP54728 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Rad23bP54728 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Rad23bP54728 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Rad23bP54728 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Rad23bP54728 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Rad23bP54728 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Rad23bP54728 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Rad23bP54728 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Rad23bP54728 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Rad23bP54728 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Rad23bP54728 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Rad23bP54728 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Rad23bP54728 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
Rad23bP54728 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Rad23bP54728 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Rad23bP54728 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Rad23bP54728 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Rad23bP54728 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Rad23bP54728 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Rad23bP54728 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Rad23bP54728 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
Rad23bP54728 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Rad23bP54728 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Rad23bP54728 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Rad23bP54728 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Rad23bP54728 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Rad23bP54728 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Rad23bP54728 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Rad23bP54728 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Rad23bP54728 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Rad23bP54728 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Rad23bP54728 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Rad23bP54728 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Rad23bP54728 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Rad23bP54728 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Rad23bP54728 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Rad23bP54728 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Rad23bP54728 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Rad23bP54728 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Rad23bP54728 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Rad23bP54728 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Rad23bP54728 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Rad23bP54728 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Rad23bP54728 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Rad23bP54728 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Rad23bP54728 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Rad23bP54728 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Rad23bP54728 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Rad23bP54728 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
Rad23bP54728 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Rad23bP54728 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Rad23bP54728 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Rad23bP54728 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Rad23bP54728 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Rad23bP54728 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.2
Rad23bP54728 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Rad23bP54728 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Rad23bP54728 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Rad23bP54728 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms