Protein–RNA interactions for Protein: P54254

Atxn1, Ataxin-1, mousemouse

Predictions only

Length 791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn1P54254 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atxn1P54254 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atxn1P54254 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atxn1P54254 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atxn1P54254 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atxn1P54254 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Atxn1P54254 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atxn1P54254 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Atxn1P54254 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atxn1P54254 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atxn1P54254 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Atxn1P54254 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Atxn1P54254 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Atxn1P54254 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Atxn1P54254 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Atxn1P54254 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Atxn1P54254 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Atxn1P54254 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Atxn1P54254 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atxn1P54254 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atxn1P54254 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Atxn1P54254 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atxn1P54254 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atxn1P54254 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atxn1P54254 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atxn1P54254 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atxn1P54254 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Atxn1P54254 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Atxn1P54254 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atxn1P54254 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Atxn1P54254 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atxn1P54254 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Atxn1P54254 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atxn1P54254 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atxn1P54254 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Atxn1P54254 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Atxn1P54254 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atxn1P54254 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Atxn1P54254 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Atxn1P54254 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Atxn1P54254 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atxn1P54254 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Atxn1P54254 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atxn1P54254 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atxn1P54254 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Atxn1P54254 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atxn1P54254 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atxn1P54254 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Atxn1P54254 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atxn1P54254 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Atxn1P54254 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Atxn1P54254 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atxn1P54254 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atxn1P54254 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atxn1P54254 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Atxn1P54254 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Atxn1P54254 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atxn1P54254 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Atxn1P54254 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atxn1P54254 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atxn1P54254 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atxn1P54254 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atxn1P54254 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atxn1P54254 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atxn1P54254 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Atxn1P54254 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atxn1P54254 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atxn1P54254 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atxn1P54254 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Atxn1P54254 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atxn1P54254 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atxn1P54254 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atxn1P54254 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atxn1P54254 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atxn1P54254 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atxn1P54254 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atxn1P54254 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atxn1P54254 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atxn1P54254 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Atxn1P54254 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Atxn1P54254 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Atxn1P54254 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Atxn1P54254 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Atxn1P54254 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Atxn1P54254 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Atxn1P54254 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atxn1P54254 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atxn1P54254 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atxn1P54254 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atxn1P54254 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atxn1P54254 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atxn1P54254 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atxn1P54254 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atxn1P54254 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atxn1P54254 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atxn1P54254 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atxn1P54254 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atxn1P54254 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atxn1P54254 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atxn1P54254 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms