Protein–RNA interactions for Protein: P53996

Cnbp, Cellular nucleic acid-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CnbpP53996 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CnbpP53996 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CnbpP53996 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CnbpP53996 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CnbpP53996 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CnbpP53996 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CnbpP53996 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CnbpP53996 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CnbpP53996 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CnbpP53996 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CnbpP53996 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CnbpP53996 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CnbpP53996 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CnbpP53996 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CnbpP53996 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CnbpP53996 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CnbpP53996 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CnbpP53996 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
CnbpP53996 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CnbpP53996 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
CnbpP53996 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
CnbpP53996 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
CnbpP53996 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CnbpP53996 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CnbpP53996 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CnbpP53996 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CnbpP53996 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CnbpP53996 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CnbpP53996 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CnbpP53996 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CnbpP53996 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CnbpP53996 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CnbpP53996 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CnbpP53996 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CnbpP53996 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CnbpP53996 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CnbpP53996 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CnbpP53996 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CnbpP53996 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CnbpP53996 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
CnbpP53996 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CnbpP53996 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CnbpP53996 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CnbpP53996 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CnbpP53996 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CnbpP53996 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CnbpP53996 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CnbpP53996 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CnbpP53996 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CnbpP53996 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CnbpP53996 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CnbpP53996 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CnbpP53996 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CnbpP53996 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CnbpP53996 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CnbpP53996 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CnbpP53996 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CnbpP53996 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CnbpP53996 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CnbpP53996 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CnbpP53996 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CnbpP53996 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CnbpP53996 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CnbpP53996 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CnbpP53996 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CnbpP53996 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CnbpP53996 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CnbpP53996 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CnbpP53996 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CnbpP53996 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CnbpP53996 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CnbpP53996 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CnbpP53996 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CnbpP53996 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CnbpP53996 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CnbpP53996 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CnbpP53996 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CnbpP53996 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CnbpP53996 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CnbpP53996 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CnbpP53996 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CnbpP53996 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CnbpP53996 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CnbpP53996 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CnbpP53996 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CnbpP53996 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CnbpP53996 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CnbpP53996 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CnbpP53996 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CnbpP53996 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CnbpP53996 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CnbpP53996 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CnbpP53996 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CnbpP53996 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CnbpP53996 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CnbpP53996 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CnbpP53996 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CnbpP53996 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CnbpP53996 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CnbpP53996 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 121.6 ms