Protein–RNA interactions for Protein: P52875

Tmem165, Transmembrane protein 165, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem165P52875 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Tmem165P52875 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tmem165P52875 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tmem165P52875 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tmem165P52875 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tmem165P52875 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tmem165P52875 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tmem165P52875 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tmem165P52875 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tmem165P52875 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tmem165P52875 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tmem165P52875 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tmem165P52875 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tmem165P52875 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Tmem165P52875 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tmem165P52875 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tmem165P52875 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tmem165P52875 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tmem165P52875 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tmem165P52875 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tmem165P52875 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tmem165P52875 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tmem165P52875 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmem165P52875 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmem165P52875 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmem165P52875 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmem165P52875 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmem165P52875 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmem165P52875 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmem165P52875 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmem165P52875 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmem165P52875 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmem165P52875 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmem165P52875 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tmem165P52875 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tmem165P52875 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tmem165P52875 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
Tmem165P52875 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Tmem165P52875 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tmem165P52875 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Tmem165P52875 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tmem165P52875 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tmem165P52875 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Tmem165P52875 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Tmem165P52875 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Tmem165P52875 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tmem165P52875 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tmem165P52875 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Tmem165P52875 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Tmem165P52875 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tmem165P52875 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tmem165P52875 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tmem165P52875 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tmem165P52875 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tmem165P52875 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tmem165P52875 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tmem165P52875 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tmem165P52875 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tmem165P52875 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tmem165P52875 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Tmem165P52875 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tmem165P52875 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Tmem165P52875 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tmem165P52875 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tmem165P52875 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tmem165P52875 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tmem165P52875 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tmem165P52875 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tmem165P52875 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tmem165P52875 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tmem165P52875 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tmem165P52875 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tmem165P52875 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Tmem165P52875 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tmem165P52875 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tmem165P52875 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tmem165P52875 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tmem165P52875 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tmem165P52875 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tmem165P52875 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tmem165P52875 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tmem165P52875 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tmem165P52875 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tmem165P52875 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tmem165P52875 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tmem165P52875 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tmem165P52875 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tmem165P52875 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tmem165P52875 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tmem165P52875 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tmem165P52875 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tmem165P52875 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tmem165P52875 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tmem165P52875 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tmem165P52875 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tmem165P52875 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tmem165P52875 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tmem165P52875 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tmem165P52875 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tmem165P52875 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms