Protein–RNA interactions for Protein: P50705

Defa7, Alpha-defensin 7, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa7P50705 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Defa7P50705 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Defa7P50705 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Defa7P50705 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Defa7P50705 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Defa7P50705 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Defa7P50705 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Defa7P50705 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Defa7P50705 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Defa7P50705 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Defa7P50705 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Defa7P50705 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Defa7P50705 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Defa7P50705 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Defa7P50705 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Defa7P50705 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Defa7P50705 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Defa7P50705 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Defa7P50705 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Defa7P50705 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Defa7P50705 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Defa7P50705 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Defa7P50705 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Defa7P50705 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Defa7P50705 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Defa7P50705 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Defa7P50705 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Defa7P50705 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Defa7P50705 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Defa7P50705 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Defa7P50705 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Defa7P50705 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Defa7P50705 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Defa7P50705 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Defa7P50705 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Defa7P50705 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Defa7P50705 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Defa7P50705 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Defa7P50705 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Defa7P50705 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Defa7P50705 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Defa7P50705 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Defa7P50705 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Defa7P50705 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Defa7P50705 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Defa7P50705 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Defa7P50705 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Defa7P50705 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Defa7P50705 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Defa7P50705 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Defa7P50705 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Defa7P50705 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Defa7P50705 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Defa7P50705 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Defa7P50705 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Defa7P50705 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Defa7P50705 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Defa7P50705 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Defa7P50705 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Defa7P50705 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Defa7P50705 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Defa7P50705 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Defa7P50705 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Defa7P50705 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Defa7P50705 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Defa7P50705 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Defa7P50705 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Defa7P50705 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Defa7P50705 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Defa7P50705 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Defa7P50705 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Defa7P50705 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Defa7P50705 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Defa7P50705 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Defa7P50705 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Defa7P50705 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Defa7P50705 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Defa7P50705 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Defa7P50705 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Defa7P50705 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Defa7P50705 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Defa7P50705 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Defa7P50705 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Defa7P50705 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Defa7P50705 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Defa7P50705 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Defa7P50705 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Defa7P50705 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Defa7P50705 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Defa7P50705 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Defa7P50705 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Defa7P50705 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Defa7P50705 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Defa7P50705 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Defa7P50705 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Defa7P50705 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Defa7P50705 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Defa7P50705 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Defa7P50705 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Defa7P50705 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms