Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tmod1P49813 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tmod1P49813 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tmod1P49813 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tmod1P49813 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tmod1P49813 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tmod1P49813 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Tmod1P49813 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tmod1P49813 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tmod1P49813 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tmod1P49813 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tmod1P49813 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Tmod1P49813 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Tmod1P49813 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Tmod1P49813 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Tmod1P49813 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tmod1P49813 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tmod1P49813 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tmod1P49813 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tmod1P49813 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tmod1P49813 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tmod1P49813 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tmod1P49813 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tmod1P49813 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tmod1P49813 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tmod1P49813 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tmod1P49813 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Tmod1P49813 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tmod1P49813 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Tmod1P49813 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Tmod1P49813 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tmod1P49813 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tmod1P49813 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tmod1P49813 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tmod1P49813 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tmod1P49813 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tmod1P49813 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tmod1P49813 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tmod1P49813 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tmod1P49813 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tmod1P49813 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tmod1P49813 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tmod1P49813 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tmod1P49813 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tmod1P49813 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tmod1P49813 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tmod1P49813 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tmod1P49813 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tmod1P49813 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tmod1P49813 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tmod1P49813 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tmod1P49813 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tmod1P49813 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tmod1P49813 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tmod1P49813 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tmod1P49813 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tmod1P49813 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tmod1P49813 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tmod1P49813 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tmod1P49813 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Tmod1P49813 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tmod1P49813 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tmod1P49813 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tmod1P49813 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Tmod1P49813 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tmod1P49813 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tmod1P49813 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tmod1P49813 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tmod1P49813 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tmod1P49813 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tmod1P49813 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tmod1P49813 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tmod1P49813 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tmod1P49813 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tmod1P49813 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tmod1P49813 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tmod1P49813 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tmod1P49813 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tmod1P49813 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tmod1P49813 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tmod1P49813 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tmod1P49813 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Tmod1P49813 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tmod1P49813 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tmod1P49813 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tmod1P49813 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Tmod1P49813 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Tmod1P49813 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tmod1P49813 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Tmod1P49813 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Tmod1P49813 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tmod1P49813 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tmod1P49813 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tmod1P49813 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tmod1P49813 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tmod1P49813 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tmod1P49813 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tmod1P49813 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tmod1P49813 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tmod1P49813 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms