Protein–RNA interactions for Protein: P47939

Resp18, Regulated endocrine-specific protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Resp18P47939 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Resp18P47939 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Resp18P47939 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Resp18P47939 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Resp18P47939 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Resp18P47939 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Resp18P47939 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Resp18P47939 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Resp18P47939 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Resp18P47939 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Resp18P47939 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Resp18P47939 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Resp18P47939 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Resp18P47939 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Resp18P47939 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Resp18P47939 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Resp18P47939 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Resp18P47939 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Resp18P47939 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Resp18P47939 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Resp18P47939 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Resp18P47939 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Resp18P47939 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Resp18P47939 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Resp18P47939 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Resp18P47939 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Resp18P47939 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Resp18P47939 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Resp18P47939 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Resp18P47939 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Resp18P47939 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Resp18P47939 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Resp18P47939 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Resp18P47939 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Resp18P47939 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Resp18P47939 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Resp18P47939 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Resp18P47939 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Resp18P47939 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Resp18P47939 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Resp18P47939 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Resp18P47939 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Resp18P47939 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Resp18P47939 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Resp18P47939 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Resp18P47939 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Resp18P47939 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Resp18P47939 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Resp18P47939 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Resp18P47939 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Resp18P47939 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Resp18P47939 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Resp18P47939 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Resp18P47939 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Resp18P47939 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Resp18P47939 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Resp18P47939 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Resp18P47939 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Resp18P47939 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Resp18P47939 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Resp18P47939 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Resp18P47939 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Resp18P47939 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Resp18P47939 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Resp18P47939 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Resp18P47939 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Resp18P47939 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Resp18P47939 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Resp18P47939 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Resp18P47939 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Resp18P47939 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Resp18P47939 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Resp18P47939 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Resp18P47939 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Resp18P47939 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Resp18P47939 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Resp18P47939 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Resp18P47939 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Resp18P47939 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Resp18P47939 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Resp18P47939 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Resp18P47939 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Resp18P47939 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Resp18P47939 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Resp18P47939 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Resp18P47939 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Resp18P47939 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Resp18P47939 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Resp18P47939 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Resp18P47939 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Resp18P47939 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Resp18P47939 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Resp18P47939 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Resp18P47939 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Resp18P47939 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Resp18P47939 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Resp18P47939 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Resp18P47939 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Resp18P47939 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Resp18P47939 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 143 ms