Protein–RNA interactions for Protein: P40749

Syt4, Synaptotagmin-4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syt4P40749 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Syt4P40749 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Syt4P40749 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Syt4P40749 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Syt4P40749 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Syt4P40749 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Syt4P40749 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Syt4P40749 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Syt4P40749 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Syt4P40749 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Syt4P40749 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Syt4P40749 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Syt4P40749 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Syt4P40749 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Syt4P40749 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Syt4P40749 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Syt4P40749 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Syt4P40749 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Syt4P40749 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Syt4P40749 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Syt4P40749 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Syt4P40749 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Syt4P40749 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Syt4P40749 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Syt4P40749 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Syt4P40749 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Syt4P40749 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Syt4P40749 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Syt4P40749 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Syt4P40749 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Syt4P40749 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Syt4P40749 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Syt4P40749 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Syt4P40749 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Syt4P40749 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Syt4P40749 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Syt4P40749 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Syt4P40749 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Syt4P40749 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Syt4P40749 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Syt4P40749 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Syt4P40749 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Syt4P40749 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Syt4P40749 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Syt4P40749 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Syt4P40749 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Syt4P40749 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Syt4P40749 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Syt4P40749 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Syt4P40749 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Syt4P40749 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Syt4P40749 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Syt4P40749 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Syt4P40749 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Syt4P40749 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Syt4P40749 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Syt4P40749 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Syt4P40749 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Syt4P40749 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Syt4P40749 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Syt4P40749 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Syt4P40749 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Syt4P40749 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Syt4P40749 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Syt4P40749 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Syt4P40749 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Syt4P40749 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Syt4P40749 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Syt4P40749 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Syt4P40749 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Syt4P40749 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Syt4P40749 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Syt4P40749 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Syt4P40749 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Syt4P40749 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Syt4P40749 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Syt4P40749 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Syt4P40749 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Syt4P40749 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Syt4P40749 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Syt4P40749 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Syt4P40749 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Syt4P40749 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Syt4P40749 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Syt4P40749 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Syt4P40749 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Syt4P40749 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Syt4P40749 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Syt4P40749 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Syt4P40749 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Syt4P40749 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Syt4P40749 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Syt4P40749 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Syt4P40749 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Syt4P40749 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Syt4P40749 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Syt4P40749 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Syt4P40749 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Syt4P40749 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Syt4P40749 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms