Protein–RNA interactions for Protein: P35288

Rab23, Ras-related protein Rab-23, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab23P35288 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rab23P35288 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rab23P35288 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rab23P35288 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Rab23P35288 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Rab23P35288 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rab23P35288 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rab23P35288 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rab23P35288 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rab23P35288 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rab23P35288 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rab23P35288 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Rab23P35288 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rab23P35288 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rab23P35288 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rab23P35288 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rab23P35288 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rab23P35288 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rab23P35288 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rab23P35288 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rab23P35288 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rab23P35288 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rab23P35288 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Rab23P35288 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rab23P35288 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rab23P35288 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rab23P35288 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rab23P35288 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rab23P35288 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Rab23P35288 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rab23P35288 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rab23P35288 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rab23P35288 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rab23P35288 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rab23P35288 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rab23P35288 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rab23P35288 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rab23P35288 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rab23P35288 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rab23P35288 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rab23P35288 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rab23P35288 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rab23P35288 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rab23P35288 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rab23P35288 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rab23P35288 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rab23P35288 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rab23P35288 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rab23P35288 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rab23P35288 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rab23P35288 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rab23P35288 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rab23P35288 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rab23P35288 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rab23P35288 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rab23P35288 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rab23P35288 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rab23P35288 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Rab23P35288 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Rab23P35288 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rab23P35288 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rab23P35288 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rab23P35288 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rab23P35288 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rab23P35288 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rab23P35288 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rab23P35288 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rab23P35288 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rab23P35288 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rab23P35288 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rab23P35288 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rab23P35288 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rab23P35288 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rab23P35288 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Rab23P35288 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rab23P35288 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rab23P35288 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rab23P35288 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rab23P35288 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rab23P35288 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rab23P35288 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rab23P35288 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Rab23P35288 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rab23P35288 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rab23P35288 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rab23P35288 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Rab23P35288 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rab23P35288 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rab23P35288 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rab23P35288 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rab23P35288 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rab23P35288 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rab23P35288 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rab23P35288 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rab23P35288 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rab23P35288 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rab23P35288 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rab23P35288 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rab23P35288 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rab23P35288 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms