Protein–RNA interactions for Protein: P35282

Rab21, Ras-related protein Rab-21, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab21P35282 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rab21P35282 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rab21P35282 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Rab21P35282 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rab21P35282 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rab21P35282 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Rab21P35282 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rab21P35282 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rab21P35282 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rab21P35282 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rab21P35282 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rab21P35282 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rab21P35282 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rab21P35282 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Rab21P35282 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rab21P35282 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rab21P35282 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rab21P35282 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rab21P35282 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rab21P35282 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rab21P35282 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rab21P35282 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rab21P35282 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rab21P35282 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Rab21P35282 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rab21P35282 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rab21P35282 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rab21P35282 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rab21P35282 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rab21P35282 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rab21P35282 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rab21P35282 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rab21P35282 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rab21P35282 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rab21P35282 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rab21P35282 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rab21P35282 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rab21P35282 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rab21P35282 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rab21P35282 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rab21P35282 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rab21P35282 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rab21P35282 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rab21P35282 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rab21P35282 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rab21P35282 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rab21P35282 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rab21P35282 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rab21P35282 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rab21P35282 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rab21P35282 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rab21P35282 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rab21P35282 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Rab21P35282 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
Rab21P35282 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Rab21P35282 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Rab21P35282 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rab21P35282 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rab21P35282 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rab21P35282 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rab21P35282 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rab21P35282 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rab21P35282 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rab21P35282 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rab21P35282 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rab21P35282 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rab21P35282 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rab21P35282 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rab21P35282 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rab21P35282 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rab21P35282 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rab21P35282 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rab21P35282 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rab21P35282 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rab21P35282 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rab21P35282 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rab21P35282 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rab21P35282 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rab21P35282 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rab21P35282 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rab21P35282 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rab21P35282 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rab21P35282 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rab21P35282 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rab21P35282 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rab21P35282 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rab21P35282 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rab21P35282 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rab21P35282 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rab21P35282 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rab21P35282 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rab21P35282 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rab21P35282 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rab21P35282 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rab21P35282 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rab21P35282 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rab21P35282 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rab21P35282 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rab21P35282 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rab21P35282 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms