Protein–RNA interactions for Protein: P35242

Sftpa1, Pulmonary surfactant-associated protein A, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sftpa1P35242 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sftpa1P35242 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sftpa1P35242 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sftpa1P35242 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sftpa1P35242 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sftpa1P35242 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sftpa1P35242 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sftpa1P35242 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sftpa1P35242 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sftpa1P35242 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Sftpa1P35242 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sftpa1P35242 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sftpa1P35242 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sftpa1P35242 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Sftpa1P35242 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sftpa1P35242 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sftpa1P35242 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sftpa1P35242 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sftpa1P35242 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sftpa1P35242 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sftpa1P35242 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sftpa1P35242 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sftpa1P35242 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sftpa1P35242 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sftpa1P35242 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sftpa1P35242 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sftpa1P35242 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sftpa1P35242 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sftpa1P35242 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Sftpa1P35242 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sftpa1P35242 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sftpa1P35242 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sftpa1P35242 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sftpa1P35242 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sftpa1P35242 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Sftpa1P35242 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sftpa1P35242 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sftpa1P35242 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sftpa1P35242 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sftpa1P35242 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sftpa1P35242 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sftpa1P35242 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sftpa1P35242 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Sftpa1P35242 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sftpa1P35242 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sftpa1P35242 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sftpa1P35242 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sftpa1P35242 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sftpa1P35242 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Sftpa1P35242 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sftpa1P35242 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sftpa1P35242 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sftpa1P35242 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sftpa1P35242 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sftpa1P35242 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sftpa1P35242 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sftpa1P35242 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sftpa1P35242 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sftpa1P35242 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sftpa1P35242 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sftpa1P35242 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sftpa1P35242 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sftpa1P35242 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Sftpa1P35242 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sftpa1P35242 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sftpa1P35242 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sftpa1P35242 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sftpa1P35242 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sftpa1P35242 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sftpa1P35242 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sftpa1P35242 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sftpa1P35242 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sftpa1P35242 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sftpa1P35242 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sftpa1P35242 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sftpa1P35242 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sftpa1P35242 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Sftpa1P35242 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sftpa1P35242 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sftpa1P35242 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sftpa1P35242 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sftpa1P35242 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sftpa1P35242 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sftpa1P35242 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sftpa1P35242 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sftpa1P35242 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sftpa1P35242 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sftpa1P35242 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sftpa1P35242 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sftpa1P35242 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sftpa1P35242 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Sftpa1P35242 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sftpa1P35242 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Sftpa1P35242 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Sftpa1P35242 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sftpa1P35242 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sftpa1P35242 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sftpa1P35242 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sftpa1P35242 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sftpa1P35242 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms