Protein–RNA interactions for Protein: P35235

Ptpn11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn11P35235 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ptpn11P35235 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ptpn11P35235 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ptpn11P35235 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ptpn11P35235 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ptpn11P35235 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ptpn11P35235 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ptpn11P35235 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ptpn11P35235 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ptpn11P35235 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ptpn11P35235 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ptpn11P35235 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Ptpn11P35235 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Ptpn11P35235 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ptpn11P35235 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ptpn11P35235 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ptpn11P35235 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ptpn11P35235 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ptpn11P35235 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ptpn11P35235 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ptpn11P35235 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ptpn11P35235 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ptpn11P35235 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Ptpn11P35235 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ptpn11P35235 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ptpn11P35235 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ptpn11P35235 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ptpn11P35235 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Ptpn11P35235 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Ptpn11P35235 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ptpn11P35235 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ptpn11P35235 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ptpn11P35235 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ptpn11P35235 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ptpn11P35235 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ptpn11P35235 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ptpn11P35235 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Ptpn11P35235 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ptpn11P35235 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ptpn11P35235 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Ptpn11P35235 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ptpn11P35235 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ptpn11P35235 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Ptpn11P35235 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ptpn11P35235 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ptpn11P35235 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ptpn11P35235 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ptpn11P35235 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ptpn11P35235 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ptpn11P35235 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ptpn11P35235 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ptpn11P35235 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ptpn11P35235 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ptpn11P35235 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ptpn11P35235 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ptpn11P35235 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ptpn11P35235 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ptpn11P35235 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ptpn11P35235 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ptpn11P35235 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ptpn11P35235 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ptpn11P35235 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ptpn11P35235 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ptpn11P35235 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ptpn11P35235 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ptpn11P35235 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ptpn11P35235 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Ptpn11P35235 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Ptpn11P35235 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ptpn11P35235 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ptpn11P35235 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ptpn11P35235 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ptpn11P35235 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ptpn11P35235 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ptpn11P35235 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ptpn11P35235 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ptpn11P35235 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Ptpn11P35235 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ptpn11P35235 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ptpn11P35235 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ptpn11P35235 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ptpn11P35235 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ptpn11P35235 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ptpn11P35235 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ptpn11P35235 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ptpn11P35235 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ptpn11P35235 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ptpn11P35235 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ptpn11P35235 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ptpn11P35235 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ptpn11P35235 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ptpn11P35235 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ptpn11P35235 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ptpn11P35235 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Ptpn11P35235 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Ptpn11P35235 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ptpn11P35235 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ptpn11P35235 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ptpn11P35235 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ptpn11P35235 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms