Protein–RNA interactions for Protein: P33435

Mmp13, Collagenase 3, mousemouse

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp13P33435 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Mmp13P33435 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Mmp13P33435 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Mmp13P33435 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Mmp13P33435 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Mmp13P33435 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Mmp13P33435 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Mmp13P33435 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Mmp13P33435 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Mmp13P33435 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Mmp13P33435 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Mmp13P33435 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Mmp13P33435 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Mmp13P33435 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Mmp13P33435 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Mmp13P33435 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Mmp13P33435 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mmp13P33435 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mmp13P33435 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mmp13P33435 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mmp13P33435 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mmp13P33435 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Mmp13P33435 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Mmp13P33435 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Mmp13P33435 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Mmp13P33435 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Mmp13P33435 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Mmp13P33435 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Mmp13P33435 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Mmp13P33435 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Mmp13P33435 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Mmp13P33435 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Mmp13P33435 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Mmp13P33435 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Mmp13P33435 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Mmp13P33435 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Mmp13P33435 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Mmp13P33435 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Mmp13P33435 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Mmp13P33435 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Mmp13P33435 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Mmp13P33435 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Mmp13P33435 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Mmp13P33435 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Mmp13P33435 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Mmp13P33435 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Mmp13P33435 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Mmp13P33435 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Mmp13P33435 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Mmp13P33435 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Mmp13P33435 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Mmp13P33435 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Mmp13P33435 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Mmp13P33435 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Mmp13P33435 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Mmp13P33435 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Mmp13P33435 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Mmp13P33435 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Mmp13P33435 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Mmp13P33435 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Mmp13P33435 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Mmp13P33435 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Mmp13P33435 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mmp13P33435 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mmp13P33435 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mmp13P33435 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mmp13P33435 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Mmp13P33435 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mmp13P33435 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mmp13P33435 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mmp13P33435 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mmp13P33435 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Mmp13P33435 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Mmp13P33435 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Mmp13P33435 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Mmp13P33435 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Mmp13P33435 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Mmp13P33435 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Mmp13P33435 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Mmp13P33435 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Mmp13P33435 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Mmp13P33435 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Mmp13P33435 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Mmp13P33435 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Mmp13P33435 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Mmp13P33435 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Mmp13P33435 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Mmp13P33435 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Mmp13P33435 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Mmp13P33435 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Mmp13P33435 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Mmp13P33435 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Mmp13P33435 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Mmp13P33435 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Mmp13P33435 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Mmp13P33435 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Mmp13P33435 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Mmp13P33435 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Mmp13P33435 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Mmp13P33435 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.3 ms