Protein–RNA interactions for Protein: P30999

Ctnnd1, Catenin delta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnd1P30999 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ctnnd1P30999 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ctnnd1P30999 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ctnnd1P30999 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ctnnd1P30999 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ctnnd1P30999 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ctnnd1P30999 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ctnnd1P30999 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ctnnd1P30999 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ctnnd1P30999 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ctnnd1P30999 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ctnnd1P30999 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ctnnd1P30999 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ctnnd1P30999 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ctnnd1P30999 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ctnnd1P30999 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ctnnd1P30999 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ctnnd1P30999 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ctnnd1P30999 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ctnnd1P30999 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Ctnnd1P30999 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ctnnd1P30999 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ctnnd1P30999 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ctnnd1P30999 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ctnnd1P30999 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ctnnd1P30999 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ctnnd1P30999 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ctnnd1P30999 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ctnnd1P30999 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ctnnd1P30999 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Ctnnd1P30999 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ctnnd1P30999 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ctnnd1P30999 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ctnnd1P30999 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ctnnd1P30999 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ctnnd1P30999 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Ctnnd1P30999 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ctnnd1P30999 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ctnnd1P30999 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ctnnd1P30999 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ctnnd1P30999 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ctnnd1P30999 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ctnnd1P30999 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ctnnd1P30999 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Ctnnd1P30999 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ctnnd1P30999 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ctnnd1P30999 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ctnnd1P30999 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ctnnd1P30999 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ctnnd1P30999 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ctnnd1P30999 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ctnnd1P30999 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ctnnd1P30999 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ctnnd1P30999 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ctnnd1P30999 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ctnnd1P30999 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Ctnnd1P30999 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ctnnd1P30999 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ctnnd1P30999 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ctnnd1P30999 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Ctnnd1P30999 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ctnnd1P30999 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ctnnd1P30999 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ctnnd1P30999 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ctnnd1P30999 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ctnnd1P30999 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ctnnd1P30999 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ctnnd1P30999 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ctnnd1P30999 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ctnnd1P30999 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ctnnd1P30999 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ctnnd1P30999 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ctnnd1P30999 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ctnnd1P30999 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ctnnd1P30999 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ctnnd1P30999 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ctnnd1P30999 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ctnnd1P30999 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ctnnd1P30999 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ctnnd1P30999 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ctnnd1P30999 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ctnnd1P30999 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Ctnnd1P30999 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Ctnnd1P30999 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ctnnd1P30999 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Ctnnd1P30999 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ctnnd1P30999 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ctnnd1P30999 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ctnnd1P30999 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ctnnd1P30999 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ctnnd1P30999 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ctnnd1P30999 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ctnnd1P30999 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ctnnd1P30999 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ctnnd1P30999 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ctnnd1P30999 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ctnnd1P30999 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ctnnd1P30999 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ctnnd1P30999 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ctnnd1P30999 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms