Protein–RNA interactions for Protein: P29594

Casp2, Caspase-2, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp2P29594 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Casp2P29594 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Casp2P29594 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Casp2P29594 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Casp2P29594 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Casp2P29594 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Casp2P29594 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Casp2P29594 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Casp2P29594 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Casp2P29594 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Casp2P29594 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Casp2P29594 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Casp2P29594 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Casp2P29594 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Casp2P29594 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Casp2P29594 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Casp2P29594 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Casp2P29594 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Casp2P29594 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Casp2P29594 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Casp2P29594 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Casp2P29594 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Casp2P29594 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Casp2P29594 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Casp2P29594 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Casp2P29594 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Casp2P29594 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Casp2P29594 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Casp2P29594 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Casp2P29594 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Casp2P29594 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Casp2P29594 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Casp2P29594 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Casp2P29594 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Casp2P29594 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Casp2P29594 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Casp2P29594 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Casp2P29594 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Casp2P29594 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Casp2P29594 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Casp2P29594 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Casp2P29594 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Casp2P29594 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Casp2P29594 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Casp2P29594 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Casp2P29594 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Casp2P29594 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Casp2P29594 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Casp2P29594 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Casp2P29594 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Casp2P29594 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Casp2P29594 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Casp2P29594 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Casp2P29594 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Casp2P29594 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Casp2P29594 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Casp2P29594 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Casp2P29594 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Casp2P29594 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Casp2P29594 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Casp2P29594 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Casp2P29594 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Casp2P29594 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Casp2P29594 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Casp2P29594 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Casp2P29594 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Casp2P29594 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Casp2P29594 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Casp2P29594 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Casp2P29594 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Casp2P29594 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Casp2P29594 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Casp2P29594 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Casp2P29594 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Casp2P29594 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Casp2P29594 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Casp2P29594 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Casp2P29594 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Casp2P29594 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Casp2P29594 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Casp2P29594 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Casp2P29594 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Casp2P29594 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Casp2P29594 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Casp2P29594 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Casp2P29594 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Casp2P29594 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Casp2P29594 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Casp2P29594 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Casp2P29594 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Casp2P29594 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Casp2P29594 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Casp2P29594 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Casp2P29594 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Casp2P29594 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Casp2P29594 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Casp2P29594 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Casp2P29594 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Casp2P29594 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Casp2P29594 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms