Protein–RNA interactions for Protein: P28660

Nckap1, Nck-associated protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nckap1P28660 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nckap1P28660 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nckap1P28660 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nckap1P28660 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nckap1P28660 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nckap1P28660 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nckap1P28660 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nckap1P28660 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nckap1P28660 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Nckap1P28660 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nckap1P28660 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Nckap1P28660 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nckap1P28660 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nckap1P28660 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nckap1P28660 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nckap1P28660 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Nckap1P28660 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nckap1P28660 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nckap1P28660 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nckap1P28660 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nckap1P28660 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nckap1P28660 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nckap1P28660 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nckap1P28660 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Nckap1P28660 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Nckap1P28660 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nckap1P28660 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nckap1P28660 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Nckap1P28660 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Nckap1P28660 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nckap1P28660 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nckap1P28660 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nckap1P28660 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nckap1P28660 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nckap1P28660 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Nckap1P28660 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nckap1P28660 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nckap1P28660 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nckap1P28660 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nckap1P28660 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nckap1P28660 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nckap1P28660 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nckap1P28660 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nckap1P28660 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Nckap1P28660 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nckap1P28660 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nckap1P28660 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nckap1P28660 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nckap1P28660 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nckap1P28660 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nckap1P28660 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nckap1P28660 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Nckap1P28660 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nckap1P28660 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nckap1P28660 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nckap1P28660 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nckap1P28660 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nckap1P28660 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nckap1P28660 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nckap1P28660 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Nckap1P28660 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nckap1P28660 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nckap1P28660 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nckap1P28660 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nckap1P28660 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nckap1P28660 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nckap1P28660 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nckap1P28660 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nckap1P28660 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nckap1P28660 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nckap1P28660 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nckap1P28660 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nckap1P28660 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nckap1P28660 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nckap1P28660 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nckap1P28660 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nckap1P28660 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nckap1P28660 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nckap1P28660 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nckap1P28660 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nckap1P28660 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nckap1P28660 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nckap1P28660 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nckap1P28660 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nckap1P28660 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nckap1P28660 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nckap1P28660 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nckap1P28660 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nckap1P28660 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nckap1P28660 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nckap1P28660 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nckap1P28660 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nckap1P28660 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nckap1P28660 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nckap1P28660 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nckap1P28660 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nckap1P28660 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Nckap1P28660 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nckap1P28660 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nckap1P28660 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms