Protein–RNA interactions for Protein: P27661

H2afx, Histone H2AX, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2afxP27661 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
H2afxP27661 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
H2afxP27661 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
H2afxP27661 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
H2afxP27661 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
H2afxP27661 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
H2afxP27661 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
H2afxP27661 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
H2afxP27661 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
H2afxP27661 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
H2afxP27661 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
H2afxP27661 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
H2afxP27661 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
H2afxP27661 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
H2afxP27661 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
H2afxP27661 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
H2afxP27661 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
H2afxP27661 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
H2afxP27661 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
H2afxP27661 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
H2afxP27661 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
H2afxP27661 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
H2afxP27661 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
H2afxP27661 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
H2afxP27661 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
H2afxP27661 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
H2afxP27661 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
H2afxP27661 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
H2afxP27661 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
H2afxP27661 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
H2afxP27661 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
H2afxP27661 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
H2afxP27661 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
H2afxP27661 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
H2afxP27661 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
H2afxP27661 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
H2afxP27661 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
H2afxP27661 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
H2afxP27661 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
H2afxP27661 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
H2afxP27661 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
H2afxP27661 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
H2afxP27661 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
H2afxP27661 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
H2afxP27661 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
H2afxP27661 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
H2afxP27661 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
H2afxP27661 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
H2afxP27661 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
H2afxP27661 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
H2afxP27661 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
H2afxP27661 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
H2afxP27661 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
H2afxP27661 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
H2afxP27661 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
H2afxP27661 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
H2afxP27661 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
H2afxP27661 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
H2afxP27661 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
H2afxP27661 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
H2afxP27661 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
H2afxP27661 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
H2afxP27661 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
H2afxP27661 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
H2afxP27661 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
H2afxP27661 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
H2afxP27661 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
H2afxP27661 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
H2afxP27661 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
H2afxP27661 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
H2afxP27661 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
H2afxP27661 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
H2afxP27661 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
H2afxP27661 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
H2afxP27661 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
H2afxP27661 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
H2afxP27661 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
H2afxP27661 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
H2afxP27661 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
H2afxP27661 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
H2afxP27661 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
H2afxP27661 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
H2afxP27661 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
H2afxP27661 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
H2afxP27661 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
H2afxP27661 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
H2afxP27661 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
H2afxP27661 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
H2afxP27661 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
H2afxP27661 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
H2afxP27661 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
H2afxP27661 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
H2afxP27661 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
H2afxP27661 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
H2afxP27661 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
H2afxP27661 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
H2afxP27661 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
H2afxP27661 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
H2afxP27661 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
H2afxP27661 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms