Protein–RNA interactions for Protein: P26231

Ctnna1, Catenin alpha-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna1P26231 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ctnna1P26231 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ctnna1P26231 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ctnna1P26231 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ctnna1P26231 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ctnna1P26231 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ctnna1P26231 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ctnna1P26231 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ctnna1P26231 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ctnna1P26231 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Ctnna1P26231 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ctnna1P26231 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ctnna1P26231 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ctnna1P26231 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ctnna1P26231 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ctnna1P26231 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ctnna1P26231 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ctnna1P26231 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ctnna1P26231 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ctnna1P26231 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ctnna1P26231 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ctnna1P26231 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ctnna1P26231 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ctnna1P26231 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ctnna1P26231 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ctnna1P26231 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ctnna1P26231 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ctnna1P26231 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ctnna1P26231 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ctnna1P26231 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ctnna1P26231 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ctnna1P26231 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ctnna1P26231 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ctnna1P26231 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ctnna1P26231 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ctnna1P26231 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ctnna1P26231 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ctnna1P26231 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ctnna1P26231 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ctnna1P26231 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ctnna1P26231 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ctnna1P26231 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ctnna1P26231 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ctnna1P26231 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ctnna1P26231 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Ctnna1P26231 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ctnna1P26231 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ctnna1P26231 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ctnna1P26231 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ctnna1P26231 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ctnna1P26231 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ctnna1P26231 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ctnna1P26231 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ctnna1P26231 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ctnna1P26231 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ctnna1P26231 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ctnna1P26231 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Ctnna1P26231 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ctnna1P26231 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ctnna1P26231 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ctnna1P26231 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ctnna1P26231 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Ctnna1P26231 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ctnna1P26231 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ctnna1P26231 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ctnna1P26231 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ctnna1P26231 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ctnna1P26231 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ctnna1P26231 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ctnna1P26231 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ctnna1P26231 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ctnna1P26231 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ctnna1P26231 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ctnna1P26231 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ctnna1P26231 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ctnna1P26231 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ctnna1P26231 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ctnna1P26231 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ctnna1P26231 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ctnna1P26231 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ctnna1P26231 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ctnna1P26231 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ctnna1P26231 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Ctnna1P26231 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
Ctnna1P26231 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ctnna1P26231 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ctnna1P26231 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ctnna1P26231 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Ctnna1P26231 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Ctnna1P26231 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ctnna1P26231 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ctnna1P26231 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ctnna1P26231 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Ctnna1P26231 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ctnna1P26231 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ctnna1P26231 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ctnna1P26231 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ctnna1P26231 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ctnna1P26231 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ctnna1P26231 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.1 ms