Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ggta1P23336 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Ggta1P23336 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ggta1P23336 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ggta1P23336 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ggta1P23336 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ggta1P23336 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ggta1P23336 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ggta1P23336 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ggta1P23336 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ggta1P23336 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ggta1P23336 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ggta1P23336 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ggta1P23336 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ggta1P23336 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ggta1P23336 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ggta1P23336 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ggta1P23336 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ggta1P23336 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ggta1P23336 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ggta1P23336 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ggta1P23336 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ggta1P23336 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ggta1P23336 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Ggta1P23336 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ggta1P23336 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ggta1P23336 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ggta1P23336 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ggta1P23336 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ggta1P23336 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ggta1P23336 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ggta1P23336 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Ggta1P23336 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ggta1P23336 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
Ggta1P23336 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ggta1P23336 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Ggta1P23336 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ggta1P23336 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ggta1P23336 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Ggta1P23336 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ggta1P23336 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ggta1P23336 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ggta1P23336 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ggta1P23336 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ggta1P23336 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Ggta1P23336 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ggta1P23336 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ggta1P23336 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ggta1P23336 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ggta1P23336 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Ggta1P23336 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Ggta1P23336 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Ggta1P23336 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ggta1P23336 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ggta1P23336 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ggta1P23336 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ggta1P23336 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ggta1P23336 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ggta1P23336 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ggta1P23336 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ggta1P23336 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ggta1P23336 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ggta1P23336 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ggta1P23336 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ggta1P23336 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ggta1P23336 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Ggta1P23336 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ggta1P23336 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ggta1P23336 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ggta1P23336 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Ggta1P23336 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ggta1P23336 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Ggta1P23336 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ggta1P23336 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ggta1P23336 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ggta1P23336 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ggta1P23336 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Ggta1P23336 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ggta1P23336 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ggta1P23336 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ggta1P23336 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ggta1P23336 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ggta1P23336 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ggta1P23336 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Ggta1P23336 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ggta1P23336 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ggta1P23336 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ggta1P23336 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ggta1P23336 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ggta1P23336 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ggta1P23336 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ggta1P23336 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Ggta1P23336 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Ggta1P23336 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ggta1P23336 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ggta1P23336 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ggta1P23336 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ggta1P23336 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ggta1P23336 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Ggta1P23336 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 147.3 ms