Protein–RNA interactions for Protein: P20490

Ms4a2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a2P20490 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ms4a2P20490 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ms4a2P20490 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ms4a2P20490 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ms4a2P20490 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ms4a2P20490 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ms4a2P20490 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ms4a2P20490 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ms4a2P20490 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ms4a2P20490 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ms4a2P20490 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ms4a2P20490 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ms4a2P20490 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ms4a2P20490 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ms4a2P20490 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ms4a2P20490 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ms4a2P20490 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ms4a2P20490 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ms4a2P20490 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ms4a2P20490 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ms4a2P20490 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ms4a2P20490 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
Ms4a2P20490 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ms4a2P20490 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ms4a2P20490 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ms4a2P20490 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ms4a2P20490 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ms4a2P20490 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ms4a2P20490 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ms4a2P20490 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ms4a2P20490 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ms4a2P20490 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ms4a2P20490 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ms4a2P20490 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ms4a2P20490 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ms4a2P20490 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ms4a2P20490 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ms4a2P20490 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ms4a2P20490 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ms4a2P20490 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ms4a2P20490 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ms4a2P20490 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Ms4a2P20490 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ms4a2P20490 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ms4a2P20490 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ms4a2P20490 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ms4a2P20490 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ms4a2P20490 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ms4a2P20490 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ms4a2P20490 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ms4a2P20490 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ms4a2P20490 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Ms4a2P20490 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ms4a2P20490 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ms4a2P20490 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ms4a2P20490 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ms4a2P20490 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ms4a2P20490 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ms4a2P20490 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ms4a2P20490 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ms4a2P20490 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Ms4a2P20490 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ms4a2P20490 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ms4a2P20490 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ms4a2P20490 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ms4a2P20490 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ms4a2P20490 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ms4a2P20490 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ms4a2P20490 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Ms4a2P20490 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Ms4a2P20490 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ms4a2P20490 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ms4a2P20490 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ms4a2P20490 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ms4a2P20490 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ms4a2P20490 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ms4a2P20490 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ms4a2P20490 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ms4a2P20490 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ms4a2P20490 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ms4a2P20490 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ms4a2P20490 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ms4a2P20490 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ms4a2P20490 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ms4a2P20490 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ms4a2P20490 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ms4a2P20490 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Ms4a2P20490 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Ms4a2P20490 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ms4a2P20490 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ms4a2P20490 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ms4a2P20490 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ms4a2P20490 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ms4a2P20490 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ms4a2P20490 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ms4a2P20490 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ms4a2P20490 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ms4a2P20490 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ms4a2P20490 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ms4a2P20490 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms