Protein–RNA interactions for Protein: P19785

Esr1, Estrogen receptor, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Esr1P19785 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Esr1P19785 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Esr1P19785 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Esr1P19785 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Esr1P19785 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Esr1P19785 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Esr1P19785 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Esr1P19785 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Esr1P19785 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Esr1P19785 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Esr1P19785 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Esr1P19785 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Esr1P19785 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Esr1P19785 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Esr1P19785 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Esr1P19785 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Esr1P19785 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Esr1P19785 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Esr1P19785 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Esr1P19785 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Esr1P19785 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Esr1P19785 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Esr1P19785 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Esr1P19785 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Esr1P19785 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Esr1P19785 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Esr1P19785 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Esr1P19785 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Esr1P19785 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Esr1P19785 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Esr1P19785 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Esr1P19785 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Esr1P19785 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Esr1P19785 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Esr1P19785 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Esr1P19785 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Esr1P19785 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Esr1P19785 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Esr1P19785 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Esr1P19785 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Esr1P19785 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Esr1P19785 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Esr1P19785 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Esr1P19785 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Esr1P19785 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Esr1P19785 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Esr1P19785 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Esr1P19785 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Esr1P19785 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Esr1P19785 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Esr1P19785 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Esr1P19785 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Esr1P19785 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Esr1P19785 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Esr1P19785 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Esr1P19785 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Esr1P19785 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Esr1P19785 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Esr1P19785 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Esr1P19785 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Esr1P19785 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Esr1P19785 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Esr1P19785 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Esr1P19785 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Esr1P19785 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Esr1P19785 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Esr1P19785 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Esr1P19785 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Esr1P19785 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Esr1P19785 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Esr1P19785 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Esr1P19785 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Esr1P19785 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Esr1P19785 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Esr1P19785 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Esr1P19785 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Esr1P19785 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Esr1P19785 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Esr1P19785 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Esr1P19785 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Esr1P19785 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Esr1P19785 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Esr1P19785 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Esr1P19785 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Esr1P19785 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Esr1P19785 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Esr1P19785 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Esr1P19785 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Esr1P19785 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Esr1P19785 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Esr1P19785 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Esr1P19785 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Esr1P19785 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Esr1P19785 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Esr1P19785 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Esr1P19785 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Esr1P19785 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Esr1P19785 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Esr1P19785 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Esr1P19785 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms