Protein–RNA interactions for Protein: P19253

Rpl13a, 60S ribosomal protein L13a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl13aP19253 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rpl13aP19253 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Rpl13aP19253 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rpl13aP19253 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rpl13aP19253 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rpl13aP19253 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rpl13aP19253 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpl13aP19253 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpl13aP19253 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpl13aP19253 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpl13aP19253 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpl13aP19253 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rpl13aP19253 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rpl13aP19253 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rpl13aP19253 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rpl13aP19253 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rpl13aP19253 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rpl13aP19253 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rpl13aP19253 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rpl13aP19253 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rpl13aP19253 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpl13aP19253 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rpl13aP19253 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpl13aP19253 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpl13aP19253 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpl13aP19253 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpl13aP19253 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpl13aP19253 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpl13aP19253 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpl13aP19253 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Rpl13aP19253 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpl13aP19253 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpl13aP19253 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpl13aP19253 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpl13aP19253 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpl13aP19253 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpl13aP19253 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpl13aP19253 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rpl13aP19253 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpl13aP19253 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpl13aP19253 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpl13aP19253 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpl13aP19253 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rpl13aP19253 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpl13aP19253 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpl13aP19253 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpl13aP19253 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpl13aP19253 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpl13aP19253 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpl13aP19253 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpl13aP19253 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpl13aP19253 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpl13aP19253 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpl13aP19253 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpl13aP19253 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpl13aP19253 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rpl13aP19253 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpl13aP19253 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpl13aP19253 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpl13aP19253 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpl13aP19253 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpl13aP19253 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpl13aP19253 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpl13aP19253 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpl13aP19253 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpl13aP19253 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpl13aP19253 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rpl13aP19253 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rpl13aP19253 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rpl13aP19253 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Rpl13aP19253 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rpl13aP19253 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rpl13aP19253 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rpl13aP19253 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpl13aP19253 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpl13aP19253 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpl13aP19253 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpl13aP19253 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpl13aP19253 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpl13aP19253 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpl13aP19253 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpl13aP19253 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpl13aP19253 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpl13aP19253 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpl13aP19253 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpl13aP19253 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpl13aP19253 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpl13aP19253 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpl13aP19253 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpl13aP19253 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpl13aP19253 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpl13aP19253 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpl13aP19253 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpl13aP19253 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpl13aP19253 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpl13aP19253 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpl13aP19253 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpl13aP19253 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpl13aP19253 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpl13aP19253 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms