Protein–RNA interactions for Protein: P19070

Cr2, Complement receptor type 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,025 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cr2P19070 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cr2P19070 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cr2P19070 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cr2P19070 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cr2P19070 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cr2P19070 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cr2P19070 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cr2P19070 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Cr2P19070 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cr2P19070 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cr2P19070 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cr2P19070 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cr2P19070 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cr2P19070 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cr2P19070 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cr2P19070 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cr2P19070 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cr2P19070 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cr2P19070 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cr2P19070 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cr2P19070 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cr2P19070 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cr2P19070 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cr2P19070 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cr2P19070 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cr2P19070 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cr2P19070 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cr2P19070 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cr2P19070 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cr2P19070 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cr2P19070 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cr2P19070 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cr2P19070 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cr2P19070 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cr2P19070 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cr2P19070 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cr2P19070 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cr2P19070 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cr2P19070 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Cr2P19070 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cr2P19070 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cr2P19070 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cr2P19070 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cr2P19070 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cr2P19070 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cr2P19070 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cr2P19070 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cr2P19070 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cr2P19070 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Cr2P19070 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cr2P19070 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cr2P19070 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cr2P19070 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cr2P19070 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cr2P19070 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cr2P19070 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cr2P19070 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cr2P19070 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cr2P19070 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cr2P19070 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Cr2P19070 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cr2P19070 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cr2P19070 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cr2P19070 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cr2P19070 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cr2P19070 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Cr2P19070 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cr2P19070 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cr2P19070 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cr2P19070 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cr2P19070 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Cr2P19070 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cr2P19070 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cr2P19070 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cr2P19070 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cr2P19070 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cr2P19070 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cr2P19070 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Cr2P19070 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cr2P19070 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cr2P19070 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cr2P19070 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Cr2P19070 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cr2P19070 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cr2P19070 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cr2P19070 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cr2P19070 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cr2P19070 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cr2P19070 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Cr2P19070 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cr2P19070 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cr2P19070 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cr2P19070 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cr2P19070 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cr2P19070 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cr2P19070 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cr2P19070 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cr2P19070 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Cr2P19070 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cr2P19070 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms