Protein–RNA interactions for Protein: P18826

Phka1, Phosphorylase b kinase regulatory subunit alpha, skeletal muscle isoform, mousemouse

Predictions only

Length 1,241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phka1P18826 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Phka1P18826 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Phka1P18826 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Phka1P18826 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Phka1P18826 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Phka1P18826 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Phka1P18826 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Phka1P18826 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Phka1P18826 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Phka1P18826 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Phka1P18826 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Phka1P18826 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Phka1P18826 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Phka1P18826 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Phka1P18826 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Phka1P18826 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Phka1P18826 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Phka1P18826 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Phka1P18826 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Phka1P18826 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Phka1P18826 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Phka1P18826 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Phka1P18826 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Phka1P18826 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Phka1P18826 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Phka1P18826 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Phka1P18826 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Phka1P18826 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Phka1P18826 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Phka1P18826 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Phka1P18826 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Phka1P18826 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Phka1P18826 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Phka1P18826 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Phka1P18826 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Phka1P18826 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Phka1P18826 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Phka1P18826 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Phka1P18826 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Phka1P18826 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Phka1P18826 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Phka1P18826 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Phka1P18826 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Phka1P18826 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Phka1P18826 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Phka1P18826 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Phka1P18826 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Phka1P18826 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Phka1P18826 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Phka1P18826 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Phka1P18826 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Phka1P18826 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Phka1P18826 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Phka1P18826 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Phka1P18826 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Phka1P18826 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Phka1P18826 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Phka1P18826 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Phka1P18826 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
Phka1P18826 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Phka1P18826 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Phka1P18826 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Phka1P18826 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Phka1P18826 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Phka1P18826 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Phka1P18826 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Phka1P18826 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Phka1P18826 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Phka1P18826 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Phka1P18826 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Phka1P18826 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Phka1P18826 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Phka1P18826 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Phka1P18826 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Phka1P18826 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Phka1P18826 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Phka1P18826 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Phka1P18826 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Phka1P18826 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Phka1P18826 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Phka1P18826 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Phka1P18826 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Phka1P18826 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Phka1P18826 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Phka1P18826 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Phka1P18826 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Phka1P18826 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Phka1P18826 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Phka1P18826 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Phka1P18826 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Phka1P18826 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Phka1P18826 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Phka1P18826 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Phka1P18826 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Phka1P18826 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Phka1P18826 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Phka1P18826 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Phka1P18826 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Phka1P18826 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Phka1P18826 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms