Protein–RNA interactions for Protein: P18340

Cxcl9, C-X-C motif chemokine 9, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl9P18340 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Cxcl9P18340 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Cxcl9P18340 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Cxcl9P18340 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Cxcl9P18340 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Cxcl9P18340 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Cxcl9P18340 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cxcl9P18340 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cxcl9P18340 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cxcl9P18340 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cxcl9P18340 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cxcl9P18340 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cxcl9P18340 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Cxcl9P18340 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Cxcl9P18340 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Cxcl9P18340 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Cxcl9P18340 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Cxcl9P18340 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Cxcl9P18340 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Cxcl9P18340 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Cxcl9P18340 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Cxcl9P18340 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Cxcl9P18340 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Cxcl9P18340 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Cxcl9P18340 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Cxcl9P18340 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Cxcl9P18340 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Cxcl9P18340 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Cxcl9P18340 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Cxcl9P18340 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Cxcl9P18340 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cxcl9P18340 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cxcl9P18340 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Cxcl9P18340 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Cxcl9P18340 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Cxcl9P18340 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cxcl9P18340 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Cxcl9P18340 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Cxcl9P18340 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Cxcl9P18340 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Cxcl9P18340 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cxcl9P18340 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cxcl9P18340 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cxcl9P18340 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cxcl9P18340 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cxcl9P18340 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Cxcl9P18340 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cxcl9P18340 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cxcl9P18340 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cxcl9P18340 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cxcl9P18340 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cxcl9P18340 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cxcl9P18340 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cxcl9P18340 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Cxcl9P18340 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Cxcl9P18340 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Cxcl9P18340 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cxcl9P18340 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cxcl9P18340 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
Cxcl9P18340 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Cxcl9P18340 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Cxcl9P18340 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Cxcl9P18340 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Cxcl9P18340 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
Cxcl9P18340 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Cxcl9P18340 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cxcl9P18340 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cxcl9P18340 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cxcl9P18340 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cxcl9P18340 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cxcl9P18340 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cxcl9P18340 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cxcl9P18340 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cxcl9P18340 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cxcl9P18340 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cxcl9P18340 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Cxcl9P18340 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cxcl9P18340 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Cxcl9P18340 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Cxcl9P18340 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
Cxcl9P18340 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Cxcl9P18340 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Cxcl9P18340 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Cxcl9P18340 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Cxcl9P18340 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Cxcl9P18340 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Cxcl9P18340 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Cxcl9P18340 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Cxcl9P18340 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Cxcl9P18340 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Cxcl9P18340 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Cxcl9P18340 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Cxcl9P18340 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Cxcl9P18340 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Cxcl9P18340 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Cxcl9P18340 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Cxcl9P18340 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Cxcl9P18340 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Cxcl9P18340 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Cxcl9P18340 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.1 ms