Protein–RNA interactions for Protein: P17433

Spi1, Transcription factor PU.1, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spi1P17433 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Spi1P17433 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Spi1P17433 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Spi1P17433 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Spi1P17433 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Spi1P17433 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Spi1P17433 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Spi1P17433 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Spi1P17433 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Spi1P17433 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Spi1P17433 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Spi1P17433 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Spi1P17433 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Spi1P17433 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Spi1P17433 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Spi1P17433 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Spi1P17433 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Spi1P17433 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Spi1P17433 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Spi1P17433 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Spi1P17433 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Spi1P17433 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Spi1P17433 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Spi1P17433 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Spi1P17433 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Spi1P17433 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Spi1P17433 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Spi1P17433 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Spi1P17433 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Spi1P17433 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Spi1P17433 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Spi1P17433 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Spi1P17433 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Spi1P17433 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Spi1P17433 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Spi1P17433 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Spi1P17433 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Spi1P17433 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Spi1P17433 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Spi1P17433 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Spi1P17433 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Spi1P17433 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Spi1P17433 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Spi1P17433 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Spi1P17433 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Spi1P17433 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Spi1P17433 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Spi1P17433 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Spi1P17433 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Spi1P17433 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Spi1P17433 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Spi1P17433 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Spi1P17433 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Spi1P17433 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Spi1P17433 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Spi1P17433 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Spi1P17433 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Spi1P17433 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Spi1P17433 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Spi1P17433 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Spi1P17433 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Spi1P17433 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Spi1P17433 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Spi1P17433 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Spi1P17433 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Spi1P17433 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Spi1P17433 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Spi1P17433 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Spi1P17433 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Spi1P17433 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Spi1P17433 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Spi1P17433 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Spi1P17433 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Spi1P17433 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Spi1P17433 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Spi1P17433 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Spi1P17433 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Spi1P17433 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Spi1P17433 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Spi1P17433 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Spi1P17433 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Spi1P17433 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Spi1P17433 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Spi1P17433 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Spi1P17433 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Spi1P17433 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Spi1P17433 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Spi1P17433 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Spi1P17433 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Spi1P17433 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Spi1P17433 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Spi1P17433 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Spi1P17433 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Spi1P17433 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Spi1P17433 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Spi1P17433 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Spi1P17433 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Spi1P17433 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Spi1P17433 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Spi1P17433 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms