Protein–RNA interactions for Protein: P16460

Ass1, Argininosuccinate synthase, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ass1P16460 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ass1P16460 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ass1P16460 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ass1P16460 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ass1P16460 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ass1P16460 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ass1P16460 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ass1P16460 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ass1P16460 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ass1P16460 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ass1P16460 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ass1P16460 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ass1P16460 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ass1P16460 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ass1P16460 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Ass1P16460 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ass1P16460 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ass1P16460 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Ass1P16460 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ass1P16460 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ass1P16460 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ass1P16460 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ass1P16460 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ass1P16460 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ass1P16460 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ass1P16460 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Ass1P16460 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Ass1P16460 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ass1P16460 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ass1P16460 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ass1P16460 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ass1P16460 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Ass1P16460 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ass1P16460 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ass1P16460 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ass1P16460 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ass1P16460 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ass1P16460 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ass1P16460 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ass1P16460 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ass1P16460 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Ass1P16460 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ass1P16460 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ass1P16460 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ass1P16460 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ass1P16460 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ass1P16460 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ass1P16460 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ass1P16460 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ass1P16460 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Ass1P16460 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ass1P16460 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ass1P16460 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ass1P16460 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ass1P16460 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ass1P16460 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ass1P16460 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ass1P16460 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ass1P16460 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ass1P16460 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ass1P16460 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Ass1P16460 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ass1P16460 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ass1P16460 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ass1P16460 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ass1P16460 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ass1P16460 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ass1P16460 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ass1P16460 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ass1P16460 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ass1P16460 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ass1P16460 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Ass1P16460 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ass1P16460 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ass1P16460 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ass1P16460 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ass1P16460 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ass1P16460 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Ass1P16460 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ass1P16460 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ass1P16460 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ass1P16460 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ass1P16460 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ass1P16460 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ass1P16460 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ass1P16460 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ass1P16460 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ass1P16460 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ass1P16460 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ass1P16460 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ass1P16460 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ass1P16460 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ass1P16460 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ass1P16460 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ass1P16460 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ass1P16460 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ass1P16460 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ass1P16460 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ass1P16460 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ass1P16460 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms