Protein–RNA interactions for Protein: P13705

Msh3, DNA mismatch repair protein Msh3, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msh3P13705 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Msh3P13705 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Msh3P13705 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Msh3P13705 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Msh3P13705 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Msh3P13705 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Msh3P13705 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Msh3P13705 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Msh3P13705 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Msh3P13705 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Msh3P13705 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Msh3P13705 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Msh3P13705 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Msh3P13705 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Msh3P13705 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Msh3P13705 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Msh3P13705 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Msh3P13705 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Msh3P13705 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Msh3P13705 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Msh3P13705 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Msh3P13705 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Msh3P13705 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Msh3P13705 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Msh3P13705 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Msh3P13705 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Msh3P13705 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Msh3P13705 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Msh3P13705 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Msh3P13705 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Msh3P13705 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Msh3P13705 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Msh3P13705 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Msh3P13705 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Msh3P13705 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Msh3P13705 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Msh3P13705 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Msh3P13705 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
Msh3P13705 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Msh3P13705 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Msh3P13705 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Msh3P13705 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Msh3P13705 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Msh3P13705 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Msh3P13705 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Msh3P13705 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Msh3P13705 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Msh3P13705 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Msh3P13705 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Msh3P13705 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Msh3P13705 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Msh3P13705 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Msh3P13705 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Msh3P13705 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Msh3P13705 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Msh3P13705 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Msh3P13705 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Msh3P13705 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Msh3P13705 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Msh3P13705 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Msh3P13705 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Msh3P13705 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Msh3P13705 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Msh3P13705 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Msh3P13705 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Msh3P13705 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Msh3P13705 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Msh3P13705 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Msh3P13705 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Msh3P13705 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Msh3P13705 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Msh3P13705 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Msh3P13705 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Msh3P13705 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Msh3P13705 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Msh3P13705 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Msh3P13705 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Msh3P13705 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Msh3P13705 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Msh3P13705 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Msh3P13705 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Msh3P13705 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Msh3P13705 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Msh3P13705 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Msh3P13705 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Msh3P13705 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Msh3P13705 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Msh3P13705 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Msh3P13705 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Msh3P13705 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Msh3P13705 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Msh3P13705 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Msh3P13705 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Msh3P13705 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Msh3P13705 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Msh3P13705 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Msh3P13705 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Msh3P13705 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Msh3P13705 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Msh3P13705 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms