Protein–RNA interactions for Protein: P12657

Chrm1, Muscarinic acetylcholine receptor M1, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrm1P12657 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Chrm1P12657 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Chrm1P12657 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Chrm1P12657 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Chrm1P12657 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Chrm1P12657 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Chrm1P12657 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Chrm1P12657 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Chrm1P12657 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Chrm1P12657 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Chrm1P12657 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Chrm1P12657 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Chrm1P12657 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Chrm1P12657 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Chrm1P12657 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Chrm1P12657 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Chrm1P12657 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Chrm1P12657 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Chrm1P12657 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Chrm1P12657 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Chrm1P12657 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Chrm1P12657 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Chrm1P12657 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Chrm1P12657 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Chrm1P12657 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Chrm1P12657 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Chrm1P12657 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Chrm1P12657 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Chrm1P12657 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Chrm1P12657 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Chrm1P12657 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Chrm1P12657 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Chrm1P12657 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Chrm1P12657 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Chrm1P12657 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Chrm1P12657 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Chrm1P12657 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Chrm1P12657 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Chrm1P12657 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Chrm1P12657 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Chrm1P12657 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Chrm1P12657 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Chrm1P12657 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Chrm1P12657 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Chrm1P12657 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Chrm1P12657 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Chrm1P12657 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Chrm1P12657 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Chrm1P12657 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Chrm1P12657 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Chrm1P12657 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Chrm1P12657 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Chrm1P12657 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Chrm1P12657 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Chrm1P12657 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Chrm1P12657 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Chrm1P12657 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Chrm1P12657 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Chrm1P12657 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Chrm1P12657 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Chrm1P12657 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Chrm1P12657 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Chrm1P12657 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Chrm1P12657 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Chrm1P12657 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Chrm1P12657 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Chrm1P12657 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Chrm1P12657 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Chrm1P12657 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Chrm1P12657 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Chrm1P12657 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Chrm1P12657 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Chrm1P12657 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Chrm1P12657 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Chrm1P12657 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Chrm1P12657 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Chrm1P12657 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Chrm1P12657 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Chrm1P12657 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Chrm1P12657 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Chrm1P12657 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Chrm1P12657 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Chrm1P12657 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Chrm1P12657 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Chrm1P12657 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Chrm1P12657 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Chrm1P12657 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Chrm1P12657 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Chrm1P12657 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Chrm1P12657 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Chrm1P12657 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Chrm1P12657 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Chrm1P12657 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Chrm1P12657 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Chrm1P12657 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Chrm1P12657 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Chrm1P12657 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Chrm1P12657 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Chrm1P12657 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Chrm1P12657 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms