Protein–RNA interactions for Protein: P12400

Ctla2b, Protein CTLA-2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctla2bP12400 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Ctla2bP12400 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ctla2bP12400 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ctla2bP12400 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ctla2bP12400 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ctla2bP12400 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ctla2bP12400 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Ctla2bP12400 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ctla2bP12400 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ctla2bP12400 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Ctla2bP12400 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ctla2bP12400 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ctla2bP12400 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ctla2bP12400 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ctla2bP12400 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ctla2bP12400 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Ctla2bP12400 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ctla2bP12400 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Ctla2bP12400 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ctla2bP12400 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ctla2bP12400 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ctla2bP12400 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ctla2bP12400 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ctla2bP12400 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ctla2bP12400 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ctla2bP12400 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ctla2bP12400 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ctla2bP12400 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ctla2bP12400 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ctla2bP12400 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ctla2bP12400 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ctla2bP12400 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ctla2bP12400 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ctla2bP12400 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ctla2bP12400 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ctla2bP12400 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Ctla2bP12400 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ctla2bP12400 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ctla2bP12400 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ctla2bP12400 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ctla2bP12400 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ctla2bP12400 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Ctla2bP12400 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Ctla2bP12400 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ctla2bP12400 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ctla2bP12400 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ctla2bP12400 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ctla2bP12400 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ctla2bP12400 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ctla2bP12400 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ctla2bP12400 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ctla2bP12400 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ctla2bP12400 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Ctla2bP12400 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ctla2bP12400 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ctla2bP12400 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ctla2bP12400 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ctla2bP12400 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ctla2bP12400 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ctla2bP12400 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Ctla2bP12400 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ctla2bP12400 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ctla2bP12400 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ctla2bP12400 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ctla2bP12400 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ctla2bP12400 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ctla2bP12400 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ctla2bP12400 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ctla2bP12400 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ctla2bP12400 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ctla2bP12400 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ctla2bP12400 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ctla2bP12400 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ctla2bP12400 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ctla2bP12400 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ctla2bP12400 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ctla2bP12400 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ctla2bP12400 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ctla2bP12400 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ctla2bP12400 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ctla2bP12400 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ctla2bP12400 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ctla2bP12400 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ctla2bP12400 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ctla2bP12400 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ctla2bP12400 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ctla2bP12400 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ctla2bP12400 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ctla2bP12400 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ctla2bP12400 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ctla2bP12400 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ctla2bP12400 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ctla2bP12400 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ctla2bP12400 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ctla2bP12400 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ctla2bP12400 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ctla2bP12400 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ctla2bP12400 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ctla2bP12400 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ctla2bP12400 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms