Protein–RNA interactions for Protein: P12032

Timp1, Metalloproteinase inhibitor 1, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timp1P12032 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Timp1P12032 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Timp1P12032 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Timp1P12032 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Timp1P12032 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Timp1P12032 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Timp1P12032 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Timp1P12032 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Timp1P12032 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Timp1P12032 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Timp1P12032 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Timp1P12032 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Timp1P12032 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Timp1P12032 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Timp1P12032 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Timp1P12032 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Timp1P12032 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Timp1P12032 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Timp1P12032 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Timp1P12032 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Timp1P12032 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Timp1P12032 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Timp1P12032 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Timp1P12032 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Timp1P12032 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Timp1P12032 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Timp1P12032 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Timp1P12032 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Timp1P12032 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Timp1P12032 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Timp1P12032 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Timp1P12032 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Timp1P12032 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Timp1P12032 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Timp1P12032 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Timp1P12032 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Timp1P12032 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Timp1P12032 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Timp1P12032 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Timp1P12032 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Timp1P12032 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Timp1P12032 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Timp1P12032 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Timp1P12032 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Timp1P12032 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Timp1P12032 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Timp1P12032 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Timp1P12032 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Timp1P12032 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Timp1P12032 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Timp1P12032 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Timp1P12032 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Timp1P12032 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Timp1P12032 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Timp1P12032 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Timp1P12032 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Timp1P12032 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Timp1P12032 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Timp1P12032 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Timp1P12032 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Timp1P12032 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Timp1P12032 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Timp1P12032 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Timp1P12032 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Timp1P12032 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Timp1P12032 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Timp1P12032 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Timp1P12032 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Timp1P12032 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Timp1P12032 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Timp1P12032 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Timp1P12032 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Timp1P12032 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Timp1P12032 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Timp1P12032 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Timp1P12032 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Timp1P12032 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Timp1P12032 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Timp1P12032 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Timp1P12032 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Timp1P12032 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Timp1P12032 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Timp1P12032 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Timp1P12032 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Timp1P12032 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Timp1P12032 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Timp1P12032 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Timp1P12032 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Timp1P12032 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Timp1P12032 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Timp1P12032 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Timp1P12032 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Timp1P12032 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Timp1P12032 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Timp1P12032 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Timp1P12032 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Timp1P12032 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Timp1P12032 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Timp1P12032 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Timp1P12032 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.7 ms