Protein–RNA interactions for Protein: P12025

Mdk, Midkine, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MdkP12025 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MdkP12025 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
MdkP12025 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MdkP12025 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MdkP12025 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MdkP12025 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MdkP12025 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
MdkP12025 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MdkP12025 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MdkP12025 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MdkP12025 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MdkP12025 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MdkP12025 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MdkP12025 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MdkP12025 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
MdkP12025 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MdkP12025 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MdkP12025 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MdkP12025 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MdkP12025 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MdkP12025 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
MdkP12025 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MdkP12025 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MdkP12025 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MdkP12025 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MdkP12025 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MdkP12025 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MdkP12025 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MdkP12025 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MdkP12025 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MdkP12025 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MdkP12025 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
MdkP12025 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MdkP12025 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MdkP12025 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MdkP12025 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MdkP12025 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
MdkP12025 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MdkP12025 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MdkP12025 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MdkP12025 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MdkP12025 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MdkP12025 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MdkP12025 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MdkP12025 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MdkP12025 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MdkP12025 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
MdkP12025 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MdkP12025 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MdkP12025 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MdkP12025 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MdkP12025 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MdkP12025 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MdkP12025 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MdkP12025 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MdkP12025 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MdkP12025 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MdkP12025 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MdkP12025 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MdkP12025 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MdkP12025 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MdkP12025 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MdkP12025 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MdkP12025 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MdkP12025 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MdkP12025 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MdkP12025 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MdkP12025 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MdkP12025 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MdkP12025 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MdkP12025 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MdkP12025 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MdkP12025 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
MdkP12025 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MdkP12025 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MdkP12025 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MdkP12025 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MdkP12025 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
MdkP12025 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MdkP12025 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MdkP12025 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MdkP12025 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MdkP12025 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MdkP12025 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MdkP12025 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MdkP12025 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MdkP12025 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MdkP12025 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MdkP12025 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MdkP12025 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
MdkP12025 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MdkP12025 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MdkP12025 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MdkP12025 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
MdkP12025 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MdkP12025 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MdkP12025 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MdkP12025 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
MdkP12025 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
MdkP12025 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms