Protein–RNA interactions for Protein: P10148

Ccl2, C-C motif chemokine 2, mousemouse

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl2P10148 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccl2P10148 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccl2P10148 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccl2P10148 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccl2P10148 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccl2P10148 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccl2P10148 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccl2P10148 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccl2P10148 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccl2P10148 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccl2P10148 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccl2P10148 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ccl2P10148 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccl2P10148 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccl2P10148 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccl2P10148 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ccl2P10148 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Ccl2P10148 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccl2P10148 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ccl2P10148 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccl2P10148 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ccl2P10148 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccl2P10148 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccl2P10148 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccl2P10148 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccl2P10148 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccl2P10148 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccl2P10148 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccl2P10148 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccl2P10148 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccl2P10148 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccl2P10148 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccl2P10148 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccl2P10148 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccl2P10148 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccl2P10148 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccl2P10148 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccl2P10148 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccl2P10148 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccl2P10148 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccl2P10148 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccl2P10148 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccl2P10148 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccl2P10148 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccl2P10148 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccl2P10148 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccl2P10148 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccl2P10148 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccl2P10148 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccl2P10148 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccl2P10148 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccl2P10148 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccl2P10148 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccl2P10148 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccl2P10148 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccl2P10148 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccl2P10148 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccl2P10148 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccl2P10148 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccl2P10148 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccl2P10148 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccl2P10148 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccl2P10148 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccl2P10148 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccl2P10148 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccl2P10148 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccl2P10148 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccl2P10148 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccl2P10148 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccl2P10148 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccl2P10148 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccl2P10148 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccl2P10148 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccl2P10148 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccl2P10148 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccl2P10148 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccl2P10148 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccl2P10148 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccl2P10148 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccl2P10148 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccl2P10148 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccl2P10148 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccl2P10148 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccl2P10148 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccl2P10148 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccl2P10148 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccl2P10148 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccl2P10148 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccl2P10148 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccl2P10148 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccl2P10148 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccl2P10148 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccl2P10148 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccl2P10148 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccl2P10148 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccl2P10148 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccl2P10148 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccl2P10148 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccl2P10148 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccl2P10148 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms