Protein–RNA interactions for Protein: P10085

Myod1, Myoblast determination protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myod1P10085 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Myod1P10085 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Myod1P10085 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Myod1P10085 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Myod1P10085 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Myod1P10085 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Myod1P10085 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Myod1P10085 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Myod1P10085 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Myod1P10085 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Myod1P10085 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Myod1P10085 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Myod1P10085 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Myod1P10085 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Myod1P10085 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Myod1P10085 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Myod1P10085 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Myod1P10085 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Myod1P10085 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Myod1P10085 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Myod1P10085 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Myod1P10085 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Myod1P10085 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Myod1P10085 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Myod1P10085 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Myod1P10085 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Myod1P10085 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Myod1P10085 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Myod1P10085 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Myod1P10085 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Myod1P10085 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Myod1P10085 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Myod1P10085 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Myod1P10085 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Myod1P10085 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Myod1P10085 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Myod1P10085 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Myod1P10085 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Myod1P10085 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Myod1P10085 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Myod1P10085 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Myod1P10085 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Myod1P10085 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Myod1P10085 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Myod1P10085 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Myod1P10085 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Myod1P10085 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Myod1P10085 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Myod1P10085 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Myod1P10085 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Myod1P10085 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Myod1P10085 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Myod1P10085 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Myod1P10085 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Myod1P10085 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Myod1P10085 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Myod1P10085 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Myod1P10085 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Myod1P10085 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Myod1P10085 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Myod1P10085 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Myod1P10085 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Myod1P10085 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Myod1P10085 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Myod1P10085 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Myod1P10085 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Myod1P10085 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Myod1P10085 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Myod1P10085 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Myod1P10085 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Myod1P10085 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Myod1P10085 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Myod1P10085 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Myod1P10085 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Myod1P10085 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Myod1P10085 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Myod1P10085 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Myod1P10085 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Myod1P10085 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Myod1P10085 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Myod1P10085 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Myod1P10085 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Myod1P10085 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Myod1P10085 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Myod1P10085 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Myod1P10085 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Myod1P10085 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Myod1P10085 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Myod1P10085 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Myod1P10085 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Myod1P10085 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Myod1P10085 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Myod1P10085 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Myod1P10085 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Myod1P10085 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Myod1P10085 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Myod1P10085 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Myod1P10085 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Myod1P10085 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Myod1P10085 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms