Protein–RNA interactions for Protein: P09581

Csf1r, Macrophage colony-stimulating factor 1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 977 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csf1rP09581 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Csf1rP09581 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Csf1rP09581 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Csf1rP09581 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Csf1rP09581 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Csf1rP09581 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Csf1rP09581 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Csf1rP09581 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Csf1rP09581 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Csf1rP09581 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Csf1rP09581 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Csf1rP09581 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Csf1rP09581 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Csf1rP09581 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Csf1rP09581 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Csf1rP09581 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Csf1rP09581 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Csf1rP09581 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Csf1rP09581 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Csf1rP09581 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Csf1rP09581 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Csf1rP09581 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Csf1rP09581 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Csf1rP09581 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Csf1rP09581 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Csf1rP09581 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Csf1rP09581 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Csf1rP09581 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Csf1rP09581 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Csf1rP09581 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Csf1rP09581 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Csf1rP09581 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Csf1rP09581 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Csf1rP09581 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Csf1rP09581 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Csf1rP09581 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Csf1rP09581 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Csf1rP09581 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Csf1rP09581 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Csf1rP09581 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Csf1rP09581 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Csf1rP09581 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Csf1rP09581 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Csf1rP09581 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Csf1rP09581 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Csf1rP09581 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Csf1rP09581 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Csf1rP09581 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Csf1rP09581 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Csf1rP09581 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Csf1rP09581 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Csf1rP09581 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Csf1rP09581 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Csf1rP09581 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Csf1rP09581 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Csf1rP09581 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Csf1rP09581 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Csf1rP09581 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Csf1rP09581 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Csf1rP09581 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Csf1rP09581 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Csf1rP09581 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Csf1rP09581 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Csf1rP09581 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Csf1rP09581 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Csf1rP09581 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Csf1rP09581 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Csf1rP09581 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Csf1rP09581 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Csf1rP09581 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Csf1rP09581 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Csf1rP09581 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Csf1rP09581 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Csf1rP09581 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Csf1rP09581 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Csf1rP09581 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Csf1rP09581 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Csf1rP09581 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Csf1rP09581 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Csf1rP09581 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Csf1rP09581 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Csf1rP09581 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Csf1rP09581 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Csf1rP09581 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Csf1rP09581 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Csf1rP09581 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Csf1rP09581 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Csf1rP09581 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Csf1rP09581 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Csf1rP09581 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Csf1rP09581 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Csf1rP09581 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Csf1rP09581 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Csf1rP09581 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Csf1rP09581 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Csf1rP09581 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Csf1rP09581 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Csf1rP09581 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Csf1rP09581 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Csf1rP09581 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.1 ms