Protein–RNA interactions for Protein: P09026

Hoxb3, Homeobox protein Hox-B3, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb3P09026 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hoxb3P09026 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hoxb3P09026 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hoxb3P09026 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Hoxb3P09026 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hoxb3P09026 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hoxb3P09026 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Hoxb3P09026 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hoxb3P09026 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Hoxb3P09026 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Hoxb3P09026 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Hoxb3P09026 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Hoxb3P09026 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hoxb3P09026 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hoxb3P09026 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hoxb3P09026 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hoxb3P09026 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Hoxb3P09026 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Hoxb3P09026 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hoxb3P09026 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Hoxb3P09026 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Hoxb3P09026 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Hoxb3P09026 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Hoxb3P09026 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hoxb3P09026 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hoxb3P09026 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hoxb3P09026 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Hoxb3P09026 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hoxb3P09026 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hoxb3P09026 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hoxb3P09026 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hoxb3P09026 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hoxb3P09026 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Hoxb3P09026 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Hoxb3P09026 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hoxb3P09026 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Hoxb3P09026 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Hoxb3P09026 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hoxb3P09026 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Hoxb3P09026 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hoxb3P09026 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hoxb3P09026 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Hoxb3P09026 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Hoxb3P09026 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hoxb3P09026 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Hoxb3P09026 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Hoxb3P09026 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hoxb3P09026 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hoxb3P09026 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hoxb3P09026 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Hoxb3P09026 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hoxb3P09026 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hoxb3P09026 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hoxb3P09026 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hoxb3P09026 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hoxb3P09026 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hoxb3P09026 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Hoxb3P09026 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hoxb3P09026 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hoxb3P09026 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hoxb3P09026 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hoxb3P09026 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Hoxb3P09026 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hoxb3P09026 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hoxb3P09026 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hoxb3P09026 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hoxb3P09026 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hoxb3P09026 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hoxb3P09026 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hoxb3P09026 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Hoxb3P09026 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hoxb3P09026 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hoxb3P09026 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hoxb3P09026 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hoxb3P09026 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hoxb3P09026 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hoxb3P09026 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hoxb3P09026 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hoxb3P09026 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Hoxb3P09026 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hoxb3P09026 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hoxb3P09026 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hoxb3P09026 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hoxb3P09026 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Hoxb3P09026 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hoxb3P09026 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Hoxb3P09026 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hoxb3P09026 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hoxb3P09026 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hoxb3P09026 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Hoxb3P09026 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Hoxb3P09026 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Hoxb3P09026 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Hoxb3P09026 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Hoxb3P09026 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hoxb3P09026 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hoxb3P09026 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hoxb3P09026 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hoxb3P09026 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hoxb3P09026 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.4 ms