Protein–RNA interactions for Protein: P08551

Nefl, Neurofilament light polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NeflP08551 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
NeflP08551 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
NeflP08551 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
NeflP08551 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
NeflP08551 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
NeflP08551 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
NeflP08551 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
NeflP08551 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
NeflP08551 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
NeflP08551 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
NeflP08551 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
NeflP08551 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
NeflP08551 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC29.65■■■□□ 2.34
NeflP08551 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
NeflP08551 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
NeflP08551 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC29.63■■■□□ 2.33
NeflP08551 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
NeflP08551 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
NeflP08551 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
NeflP08551 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
NeflP08551 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
NeflP08551 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
NeflP08551 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
NeflP08551 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
NeflP08551 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
NeflP08551 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
NeflP08551 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
NeflP08551 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
NeflP08551 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
NeflP08551 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
NeflP08551 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
NeflP08551 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
NeflP08551 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
NeflP08551 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
NeflP08551 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
NeflP08551 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
NeflP08551 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
NeflP08551 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
NeflP08551 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
NeflP08551 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
NeflP08551 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
NeflP08551 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
NeflP08551 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
NeflP08551 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
NeflP08551 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
NeflP08551 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
NeflP08551 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
NeflP08551 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
NeflP08551 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
NeflP08551 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
NeflP08551 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
NeflP08551 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
NeflP08551 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
NeflP08551 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
NeflP08551 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
NeflP08551 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
NeflP08551 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
NeflP08551 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
NeflP08551 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
NeflP08551 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
NeflP08551 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
NeflP08551 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
NeflP08551 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
NeflP08551 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
NeflP08551 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
NeflP08551 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
NeflP08551 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
NeflP08551 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
NeflP08551 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
NeflP08551 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
NeflP08551 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
NeflP08551 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
NeflP08551 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
NeflP08551 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
NeflP08551 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
NeflP08551 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
NeflP08551 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
NeflP08551 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
NeflP08551 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
NeflP08551 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
NeflP08551 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
NeflP08551 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
NeflP08551 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
NeflP08551 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
NeflP08551 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
NeflP08551 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
NeflP08551 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
NeflP08551 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
NeflP08551 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
NeflP08551 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
NeflP08551 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC29.39■■■□□ 2.3
NeflP08551 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
NeflP08551 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
NeflP08551 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
NeflP08551 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
NeflP08551 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
NeflP08551 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
NeflP08551 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
NeflP08551 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
NeflP08551 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms