Protein–RNA interactions for Protein: P07310

Ckm, Creatine kinase M-type, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CkmP07310 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CkmP07310 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CkmP07310 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CkmP07310 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CkmP07310 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CkmP07310 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CkmP07310 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CkmP07310 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CkmP07310 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CkmP07310 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CkmP07310 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CkmP07310 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CkmP07310 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CkmP07310 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CkmP07310 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CkmP07310 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CkmP07310 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CkmP07310 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CkmP07310 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CkmP07310 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CkmP07310 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CkmP07310 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CkmP07310 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CkmP07310 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CkmP07310 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CkmP07310 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CkmP07310 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CkmP07310 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CkmP07310 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CkmP07310 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CkmP07310 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CkmP07310 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CkmP07310 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CkmP07310 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CkmP07310 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CkmP07310 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CkmP07310 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CkmP07310 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CkmP07310 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CkmP07310 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CkmP07310 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CkmP07310 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CkmP07310 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CkmP07310 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CkmP07310 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CkmP07310 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CkmP07310 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CkmP07310 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CkmP07310 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CkmP07310 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CkmP07310 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CkmP07310 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CkmP07310 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CkmP07310 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CkmP07310 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CkmP07310 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CkmP07310 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CkmP07310 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CkmP07310 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CkmP07310 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CkmP07310 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CkmP07310 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CkmP07310 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CkmP07310 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CkmP07310 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CkmP07310 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CkmP07310 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CkmP07310 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CkmP07310 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CkmP07310 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CkmP07310 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CkmP07310 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CkmP07310 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CkmP07310 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CkmP07310 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CkmP07310 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CkmP07310 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CkmP07310 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CkmP07310 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CkmP07310 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CkmP07310 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CkmP07310 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CkmP07310 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CkmP07310 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CkmP07310 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CkmP07310 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CkmP07310 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CkmP07310 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CkmP07310 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CkmP07310 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CkmP07310 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CkmP07310 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CkmP07310 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CkmP07310 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CkmP07310 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CkmP07310 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CkmP07310 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CkmP07310 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CkmP07310 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CkmP07310 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms