Protein–RNA interactions for Protein: P04187

Gzmb, Granzyme B(G,H), mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GzmbP04187 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
GzmbP04187 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
GzmbP04187 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
GzmbP04187 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
GzmbP04187 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
GzmbP04187 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
GzmbP04187 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GzmbP04187 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GzmbP04187 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GzmbP04187 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GzmbP04187 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GzmbP04187 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
GzmbP04187 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GzmbP04187 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GzmbP04187 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GzmbP04187 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GzmbP04187 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GzmbP04187 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GzmbP04187 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GzmbP04187 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GzmbP04187 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GzmbP04187 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GzmbP04187 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GzmbP04187 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GzmbP04187 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
GzmbP04187 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GzmbP04187 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GzmbP04187 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GzmbP04187 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GzmbP04187 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GzmbP04187 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GzmbP04187 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
GzmbP04187 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GzmbP04187 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GzmbP04187 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GzmbP04187 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GzmbP04187 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GzmbP04187 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GzmbP04187 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GzmbP04187 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GzmbP04187 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GzmbP04187 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GzmbP04187 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GzmbP04187 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GzmbP04187 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GzmbP04187 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GzmbP04187 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GzmbP04187 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GzmbP04187 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GzmbP04187 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GzmbP04187 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GzmbP04187 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GzmbP04187 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GzmbP04187 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GzmbP04187 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GzmbP04187 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GzmbP04187 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GzmbP04187 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GzmbP04187 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GzmbP04187 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GzmbP04187 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GzmbP04187 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GzmbP04187 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GzmbP04187 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GzmbP04187 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GzmbP04187 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GzmbP04187 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GzmbP04187 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GzmbP04187 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GzmbP04187 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GzmbP04187 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GzmbP04187 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GzmbP04187 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GzmbP04187 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GzmbP04187 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GzmbP04187 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GzmbP04187 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GzmbP04187 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
GzmbP04187 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GzmbP04187 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GzmbP04187 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GzmbP04187 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GzmbP04187 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GzmbP04187 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GzmbP04187 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GzmbP04187 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GzmbP04187 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
GzmbP04187 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GzmbP04187 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GzmbP04187 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GzmbP04187 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GzmbP04187 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GzmbP04187 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
GzmbP04187 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GzmbP04187 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GzmbP04187 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GzmbP04187 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
GzmbP04187 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GzmbP04187 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GzmbP04187 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms