Protein–RNA interactions for Protein: P01887

B2m, Beta-2-microglobulin, mousemouse

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B2mP01887 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
B2mP01887 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
B2mP01887 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
B2mP01887 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
B2mP01887 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
B2mP01887 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
B2mP01887 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
B2mP01887 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
B2mP01887 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
B2mP01887 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
B2mP01887 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
B2mP01887 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
B2mP01887 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
B2mP01887 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
B2mP01887 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
B2mP01887 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
B2mP01887 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
B2mP01887 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
B2mP01887 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
B2mP01887 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
B2mP01887 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
B2mP01887 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
B2mP01887 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
B2mP01887 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
B2mP01887 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
B2mP01887 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
B2mP01887 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
B2mP01887 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
B2mP01887 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
B2mP01887 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
B2mP01887 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
B2mP01887 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
B2mP01887 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
B2mP01887 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
B2mP01887 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
B2mP01887 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
B2mP01887 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
B2mP01887 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
B2mP01887 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
B2mP01887 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
B2mP01887 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
B2mP01887 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
B2mP01887 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
B2mP01887 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
B2mP01887 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
B2mP01887 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
B2mP01887 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
B2mP01887 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
B2mP01887 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
B2mP01887 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
B2mP01887 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
B2mP01887 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
B2mP01887 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
B2mP01887 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
B2mP01887 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
B2mP01887 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
B2mP01887 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
B2mP01887 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
B2mP01887 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
B2mP01887 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
B2mP01887 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
B2mP01887 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
B2mP01887 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
B2mP01887 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
B2mP01887 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
B2mP01887 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
B2mP01887 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
B2mP01887 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
B2mP01887 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
B2mP01887 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
B2mP01887 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
B2mP01887 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
B2mP01887 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
B2mP01887 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
B2mP01887 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
B2mP01887 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
B2mP01887 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
B2mP01887 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
B2mP01887 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
B2mP01887 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
B2mP01887 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
B2mP01887 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
B2mP01887 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
B2mP01887 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
B2mP01887 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
B2mP01887 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
B2mP01887 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
B2mP01887 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
B2mP01887 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
B2mP01887 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
B2mP01887 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
B2mP01887 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
B2mP01887 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
B2mP01887 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
B2mP01887 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
B2mP01887 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
B2mP01887 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
B2mP01887 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
B2mP01887 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
B2mP01887 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms