Protein–RNA interactions for Protein: P01745

Ig heavy chain V region MPC 11, mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01745 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
P01745 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01745 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01745 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01745 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01745 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01745 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01745 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01745 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01745 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01745 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01745 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01745 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01745 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01745 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01745 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01745 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01745 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01745 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01745 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01745 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01745 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01745 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
P01745 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01745 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01745 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
P01745 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01745 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01745 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
P01745 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01745 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01745 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01745 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01745 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01745 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01745 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01745 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01745 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01745 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
P01745 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01745 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01745 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
P01745 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01745 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01745 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01745 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01745 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
P01745 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
P01745 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01745 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01745 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01745 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01745 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01745 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01745 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01745 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01745 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01745 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01745 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01745 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01745 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01745 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01745 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01745 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
P01745 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
P01745 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01745 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01745 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01745 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01745 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
P01745 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01745 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
P01745 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01745 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01745 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01745 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01745 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01745 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
P01745 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01745 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01745 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01745 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01745 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
P01745 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01745 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01745 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01745 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
P01745 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01745 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01745 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01745 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01745 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01745 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01745 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
P01745 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01745 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01745 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01745 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01745 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01745 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms