Protein–RNA interactions for Protein: P01029

C4b, Complement C4-B, mousemouse

Predictions only

Length 1,738 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4bP01029 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
C4bP01029 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
C4bP01029 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
C4bP01029 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
C4bP01029 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
C4bP01029 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
C4bP01029 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
C4bP01029 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
C4bP01029 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
C4bP01029 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
C4bP01029 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
C4bP01029 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
C4bP01029 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
C4bP01029 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
C4bP01029 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
C4bP01029 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
C4bP01029 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
C4bP01029 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
C4bP01029 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
C4bP01029 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
C4bP01029 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
C4bP01029 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
C4bP01029 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
C4bP01029 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
C4bP01029 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
C4bP01029 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
C4bP01029 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
C4bP01029 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
C4bP01029 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
C4bP01029 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
C4bP01029 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
C4bP01029 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
C4bP01029 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
C4bP01029 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
C4bP01029 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
C4bP01029 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
C4bP01029 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
C4bP01029 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
C4bP01029 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
C4bP01029 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
C4bP01029 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
C4bP01029 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
C4bP01029 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
C4bP01029 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
C4bP01029 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
C4bP01029 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
C4bP01029 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
C4bP01029 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
C4bP01029 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
C4bP01029 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
C4bP01029 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
C4bP01029 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
C4bP01029 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
C4bP01029 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
C4bP01029 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
C4bP01029 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
C4bP01029 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
C4bP01029 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
C4bP01029 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
C4bP01029 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
C4bP01029 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
C4bP01029 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
C4bP01029 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
C4bP01029 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
C4bP01029 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
C4bP01029 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
C4bP01029 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
C4bP01029 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
C4bP01029 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
C4bP01029 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
C4bP01029 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
C4bP01029 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
C4bP01029 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
C4bP01029 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
C4bP01029 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
C4bP01029 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
C4bP01029 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC29■■■□□ 2.23
C4bP01029 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
C4bP01029 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
C4bP01029 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
C4bP01029 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
C4bP01029 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
C4bP01029 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
C4bP01029 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
C4bP01029 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
C4bP01029 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
C4bP01029 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
C4bP01029 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
C4bP01029 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
C4bP01029 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
C4bP01029 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
C4bP01029 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
C4bP01029 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
C4bP01029 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
C4bP01029 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
C4bP01029 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
C4bP01029 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
C4bP01029 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
C4bP01029 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
C4bP01029 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.7 ms