Protein–RNA interactions for Protein: O89032

Sh3pxd2a, SH3 and PX domain-containing protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 1,124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3pxd2aO89032 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sh3pxd2aO89032 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Sh3pxd2aO89032 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sh3pxd2aO89032 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sh3pxd2aO89032 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sh3pxd2aO89032 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sh3pxd2aO89032 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sh3pxd2aO89032 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sh3pxd2aO89032 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sh3pxd2aO89032 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sh3pxd2aO89032 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sh3pxd2aO89032 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sh3pxd2aO89032 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sh3pxd2aO89032 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sh3pxd2aO89032 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sh3pxd2aO89032 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sh3pxd2aO89032 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sh3pxd2aO89032 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sh3pxd2aO89032 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sh3pxd2aO89032 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sh3pxd2aO89032 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sh3pxd2aO89032 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sh3pxd2aO89032 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Sh3pxd2aO89032 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sh3pxd2aO89032 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sh3pxd2aO89032 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sh3pxd2aO89032 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sh3pxd2aO89032 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sh3pxd2aO89032 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sh3pxd2aO89032 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sh3pxd2aO89032 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sh3pxd2aO89032 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sh3pxd2aO89032 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sh3pxd2aO89032 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sh3pxd2aO89032 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sh3pxd2aO89032 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sh3pxd2aO89032 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sh3pxd2aO89032 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sh3pxd2aO89032 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sh3pxd2aO89032 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sh3pxd2aO89032 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sh3pxd2aO89032 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sh3pxd2aO89032 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sh3pxd2aO89032 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Sh3pxd2aO89032 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sh3pxd2aO89032 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sh3pxd2aO89032 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sh3pxd2aO89032 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sh3pxd2aO89032 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sh3pxd2aO89032 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sh3pxd2aO89032 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sh3pxd2aO89032 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sh3pxd2aO89032 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sh3pxd2aO89032 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sh3pxd2aO89032 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sh3pxd2aO89032 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sh3pxd2aO89032 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sh3pxd2aO89032 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sh3pxd2aO89032 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sh3pxd2aO89032 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sh3pxd2aO89032 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sh3pxd2aO89032 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sh3pxd2aO89032 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sh3pxd2aO89032 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sh3pxd2aO89032 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sh3pxd2aO89032 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sh3pxd2aO89032 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sh3pxd2aO89032 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sh3pxd2aO89032 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sh3pxd2aO89032 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sh3pxd2aO89032 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Sh3pxd2aO89032 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sh3pxd2aO89032 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sh3pxd2aO89032 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sh3pxd2aO89032 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sh3pxd2aO89032 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sh3pxd2aO89032 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sh3pxd2aO89032 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Sh3pxd2aO89032 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Sh3pxd2aO89032 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sh3pxd2aO89032 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sh3pxd2aO89032 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sh3pxd2aO89032 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sh3pxd2aO89032 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sh3pxd2aO89032 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sh3pxd2aO89032 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sh3pxd2aO89032 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sh3pxd2aO89032 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sh3pxd2aO89032 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sh3pxd2aO89032 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sh3pxd2aO89032 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sh3pxd2aO89032 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sh3pxd2aO89032 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sh3pxd2aO89032 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sh3pxd2aO89032 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sh3pxd2aO89032 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sh3pxd2aO89032 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sh3pxd2aO89032 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sh3pxd2aO89032 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sh3pxd2aO89032 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms