Protein–RNA interactions for Protein: O88870

Best1, Bestrophin-1, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Best1O88870 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Best1O88870 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Best1O88870 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Best1O88870 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Best1O88870 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Best1O88870 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Best1O88870 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Best1O88870 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Best1O88870 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Best1O88870 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Best1O88870 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Best1O88870 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Best1O88870 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Best1O88870 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Best1O88870 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Best1O88870 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Best1O88870 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Best1O88870 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Best1O88870 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Best1O88870 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Best1O88870 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Best1O88870 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Best1O88870 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Best1O88870 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Best1O88870 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Best1O88870 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Best1O88870 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Best1O88870 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Best1O88870 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Best1O88870 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Best1O88870 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Best1O88870 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Best1O88870 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Best1O88870 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Best1O88870 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Best1O88870 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Best1O88870 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Best1O88870 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Best1O88870 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Best1O88870 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Best1O88870 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Best1O88870 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Best1O88870 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Best1O88870 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Best1O88870 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Best1O88870 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Best1O88870 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Best1O88870 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Best1O88870 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Best1O88870 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Best1O88870 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Best1O88870 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Best1O88870 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Best1O88870 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Best1O88870 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Best1O88870 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Best1O88870 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Best1O88870 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Best1O88870 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Best1O88870 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Best1O88870 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Best1O88870 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Best1O88870 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Best1O88870 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Best1O88870 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Best1O88870 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Best1O88870 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Best1O88870 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Best1O88870 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Best1O88870 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Best1O88870 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Best1O88870 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Best1O88870 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Best1O88870 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Best1O88870 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Best1O88870 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Best1O88870 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Best1O88870 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Best1O88870 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Best1O88870 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Best1O88870 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
Best1O88870 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Best1O88870 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Best1O88870 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Best1O88870 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Best1O88870 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Best1O88870 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Best1O88870 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Best1O88870 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Best1O88870 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Best1O88870 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Best1O88870 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Best1O88870 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Best1O88870 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Best1O88870 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Best1O88870 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Best1O88870 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Best1O88870 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Best1O88870 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Best1O88870 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms