Protein–RNA interactions for Protein: O88741

Gdap1, Ganglioside-induced differentiation-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdap1O88741 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gdap1O88741 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gdap1O88741 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gdap1O88741 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gdap1O88741 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gdap1O88741 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gdap1O88741 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gdap1O88741 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gdap1O88741 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gdap1O88741 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gdap1O88741 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gdap1O88741 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gdap1O88741 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gdap1O88741 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gdap1O88741 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gdap1O88741 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gdap1O88741 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gdap1O88741 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gdap1O88741 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gdap1O88741 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gdap1O88741 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gdap1O88741 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gdap1O88741 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gdap1O88741 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gdap1O88741 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gdap1O88741 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gdap1O88741 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gdap1O88741 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gdap1O88741 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gdap1O88741 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gdap1O88741 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gdap1O88741 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gdap1O88741 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gdap1O88741 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gdap1O88741 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gdap1O88741 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gdap1O88741 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gdap1O88741 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gdap1O88741 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gdap1O88741 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gdap1O88741 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Gdap1O88741 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gdap1O88741 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gdap1O88741 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gdap1O88741 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Gdap1O88741 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Gdap1O88741 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Gdap1O88741 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gdap1O88741 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gdap1O88741 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gdap1O88741 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gdap1O88741 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gdap1O88741 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gdap1O88741 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gdap1O88741 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Gdap1O88741 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gdap1O88741 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gdap1O88741 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gdap1O88741 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gdap1O88741 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gdap1O88741 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gdap1O88741 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gdap1O88741 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gdap1O88741 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gdap1O88741 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gdap1O88741 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gdap1O88741 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Gdap1O88741 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gdap1O88741 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gdap1O88741 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gdap1O88741 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gdap1O88741 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Gdap1O88741 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gdap1O88741 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gdap1O88741 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gdap1O88741 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gdap1O88741 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Gdap1O88741 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gdap1O88741 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gdap1O88741 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gdap1O88741 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gdap1O88741 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gdap1O88741 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gdap1O88741 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gdap1O88741 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gdap1O88741 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gdap1O88741 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gdap1O88741 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gdap1O88741 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gdap1O88741 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gdap1O88741 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gdap1O88741 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gdap1O88741 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gdap1O88741 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gdap1O88741 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gdap1O88741 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gdap1O88741 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gdap1O88741 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gdap1O88741 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gdap1O88741 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms