Protein–RNA interactions for Protein: O88554

Parp2, Poly [ADP-ribose] polymerase 2, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp2O88554 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Parp2O88554 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Parp2O88554 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Parp2O88554 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Parp2O88554 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Parp2O88554 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Parp2O88554 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Parp2O88554 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Parp2O88554 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Parp2O88554 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Parp2O88554 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Parp2O88554 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Parp2O88554 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Parp2O88554 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Parp2O88554 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Parp2O88554 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Parp2O88554 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Parp2O88554 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Parp2O88554 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Parp2O88554 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Parp2O88554 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Parp2O88554 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Parp2O88554 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Parp2O88554 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Parp2O88554 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Parp2O88554 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Parp2O88554 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Parp2O88554 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Parp2O88554 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Parp2O88554 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Parp2O88554 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Parp2O88554 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Parp2O88554 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Parp2O88554 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Parp2O88554 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Parp2O88554 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Parp2O88554 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Parp2O88554 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Parp2O88554 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Parp2O88554 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Parp2O88554 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Parp2O88554 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Parp2O88554 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Parp2O88554 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Parp2O88554 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Parp2O88554 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Parp2O88554 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Parp2O88554 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Parp2O88554 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Parp2O88554 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Parp2O88554 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Parp2O88554 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Parp2O88554 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Parp2O88554 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Parp2O88554 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Parp2O88554 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Parp2O88554 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Parp2O88554 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Parp2O88554 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Parp2O88554 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Parp2O88554 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Parp2O88554 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Parp2O88554 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Parp2O88554 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Parp2O88554 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Parp2O88554 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Parp2O88554 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Parp2O88554 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Parp2O88554 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Parp2O88554 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Parp2O88554 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Parp2O88554 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Parp2O88554 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Parp2O88554 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Parp2O88554 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Parp2O88554 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Parp2O88554 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Parp2O88554 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Parp2O88554 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Parp2O88554 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Parp2O88554 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Parp2O88554 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Parp2O88554 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Parp2O88554 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Parp2O88554 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Parp2O88554 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Parp2O88554 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Parp2O88554 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Parp2O88554 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Parp2O88554 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Parp2O88554 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Parp2O88554 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Parp2O88554 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Parp2O88554 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Parp2O88554 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Parp2O88554 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Parp2O88554 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Parp2O88554 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Parp2O88554 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Parp2O88554 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms