Protein–RNA interactions for Protein: O70551

Srpk1, SRSF protein kinase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srpk1O70551 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Srpk1O70551 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Srpk1O70551 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Srpk1O70551 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Srpk1O70551 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Srpk1O70551 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Srpk1O70551 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Srpk1O70551 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Srpk1O70551 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Srpk1O70551 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Srpk1O70551 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Srpk1O70551 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Srpk1O70551 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Srpk1O70551 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Srpk1O70551 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Srpk1O70551 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Srpk1O70551 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Srpk1O70551 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Srpk1O70551 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Srpk1O70551 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Srpk1O70551 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Srpk1O70551 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Srpk1O70551 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Srpk1O70551 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Srpk1O70551 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Srpk1O70551 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Srpk1O70551 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Srpk1O70551 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Srpk1O70551 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Srpk1O70551 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Srpk1O70551 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Srpk1O70551 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Srpk1O70551 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Srpk1O70551 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Srpk1O70551 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Srpk1O70551 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Srpk1O70551 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Srpk1O70551 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Srpk1O70551 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Srpk1O70551 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Srpk1O70551 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Srpk1O70551 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Srpk1O70551 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Srpk1O70551 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Srpk1O70551 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Srpk1O70551 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Srpk1O70551 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Srpk1O70551 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Srpk1O70551 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Srpk1O70551 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Srpk1O70551 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Srpk1O70551 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Srpk1O70551 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Srpk1O70551 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Srpk1O70551 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Srpk1O70551 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Srpk1O70551 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Srpk1O70551 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Srpk1O70551 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Srpk1O70551 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Srpk1O70551 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Srpk1O70551 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Srpk1O70551 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Srpk1O70551 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Srpk1O70551 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Srpk1O70551 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Srpk1O70551 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Srpk1O70551 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Srpk1O70551 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Srpk1O70551 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Srpk1O70551 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Srpk1O70551 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Srpk1O70551 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Srpk1O70551 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Srpk1O70551 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Srpk1O70551 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Srpk1O70551 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Srpk1O70551 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Srpk1O70551 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Srpk1O70551 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Srpk1O70551 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Srpk1O70551 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Srpk1O70551 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Srpk1O70551 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Srpk1O70551 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Srpk1O70551 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Srpk1O70551 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Srpk1O70551 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Srpk1O70551 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Srpk1O70551 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Srpk1O70551 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Srpk1O70551 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Srpk1O70551 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Srpk1O70551 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Srpk1O70551 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Srpk1O70551 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Srpk1O70551 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Srpk1O70551 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Srpk1O70551 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Srpk1O70551 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms